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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002786`

染色体: Chr02 坐标: 47930341-47933783 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002786`
名称	SmilChr02G002786
描述	uncharacterized SmilChr02G002786
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47930341 - 47933783 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011816`
GeneID	`131011816`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011816`
原始查询	`LOC131011816`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844059]; symbol=AT1G77230; hit=AT1G77230; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844059]; symbol=AT1G77230; hit=AT1G77230; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G77230` (AT1G77230) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844059] identity=50.9; qcov=1.09; evalue=1.78e-64; confidence=high
Rice	`Os02g0553500` - identity=54.8; qcov=1; evalue=2.68e-64; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF07719 (TPR_2); PF13181 (TPR_8); PF13432 (TPR_16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011816

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057795647.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057795647.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795647.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795647.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795647.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47931846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795647.1

208 aa

104

208

TPR_16

TPR_2

TPR_8

PF13432 TPR_16 74-135 aa PF13432 TPR_16 109-170 aa PF07719 TPR_2 137-169 aa PF13181 TPR_8 137-169 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795647.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	74	135	1.4e-10	42.1	Tetratricopeptide repeat
`XP_057795647.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	109	170	1.4e-10	42.1	Tetratricopeptide repeat
`XP_057795647.1`	Pfam	`PF07719`	TPR_2	Repeat	137	169	9.8e-14	51.0	Tetratricopeptide repeat
`XP_057795647.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	137	169	2.1e-08	34.4	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939664.1
AGGAAAAACTACTCCTGAAGAGTAAATAAGTAATAACCATATAGTAACTTTTTTGAAAATCATATGTTCGAAAAAAGAGCGTGGAAAGGGAAGAAAGTAAGAAAGGAAGAATTCGTGAAGAAGCGGTGGCCGAATTCAACAACTGAAGAGTAATACAGGAGTATTACTCAGAAATCCCAGAAGAAATTTCAGCTCAAAATAGTGAAAGATGAAGATGACCTGGAAGAAAAACGTTAACGACAGCAGGAACAAGACCCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011816
ATGAAGATGACCTGGAAGAAAAACGTTAACGACAGCAGGAACAAGACCCGAAAACGCCCTATTTCTTCTAATCCAAACCTTCCGTTTGAAGATGTTAATCCTGCAGCAGAGCCGCTGAACGAATGCGAATTGCTCGCAAAAGGCGGCGTACCCGACAAGAACATCAGGATTAGTGATGAGGAAGCAGAGGAAAGGAGGAAACTTGCTGGAGAATTTGAAGCTCAAGGAAATAATCTTGCTGAGGAAGGAAAATATCGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795647.1
MKMTWKKNVNDSRNKTRKRPISSNPNLPFEDVNPAAEPLNECELLAKGGVPDKNIRISDEEAEERRKLAGEFEAQGNNLAEEGKYREALVKWEAAITLVPEKAILHEQKAQVLLELGEAWNALKAATRAMELDPGWAEAWITLGRAQLNFGEPDLAIESFDKALDIKPDSVEAKEDRQAASHHVQRRKQLHSTGLSSAENRFLVGDQG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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