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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002788`

染色体: Chr02 坐标: 47945171-47946231 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002788`
名称	SmilChr02G002788
描述	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47945171 - 47946231 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011820`
GeneID	`131011820`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011820`
原始查询	`LOC131011820`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M, chloroplastic
产物	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G37925` (NdhM) subunit NDH-M of NAD(P)H:plastoquinone dehydrogenase complex [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3770591] identity=77.8; qcov=0.775; evalue=5.09e-90; confidence=high
Rice	`Os04g0539000` (ndhM) - identity=71.5; qcov=0.74; evalue=1.81e-77; confidence=high
GO	GO:0016655 (oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H, quinone or similar compound as acceptor)
KEGG	-
Pfam	PF10664 (NdhM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011820

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057795666.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057795666.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057795666.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795666.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795666.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47945614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:47945695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:47945782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr2:47945835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B118,B83,C82,D4
`Chr2:47945839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,B77,B91,D2
`Chr2:47945880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C86
`Chr2:47945956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B77,B91,C47,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795666.1

204 aa

102

204

NdhM

PF10664 NdhM 34-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795666.1`	Pfam	`PF10664`	NdhM	Domain	34	192	2e-89	298.7	Cyanobacterial and plastid NDH-1 subunit M

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939683.1
GTGTAGGTTTATTTGCCACAAGTAATTTTTTTCATGGCAAAAAGAGGGTAAAACCCAAATTTACTCGGCTCTTAACTCATGTATTGACCTGAGCATTGACAATTGAAGGTAAATATTTATGGAGATAATAGTAATAGAATTATATTTTGGTATTCTTCTAACGCAAGATAACAAAAACCCTTATCCACAAACAACAAAATGAGGACAGAAATCCAGCACGGAGTTGAGAAAACCAAGTGAGGAGAAAACATCCACAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011820
ATGGCTGCTGCCTCCTCAGCCTACGCCGGCTTCTCGATGCGGCCATGGAGAAGCAGCAGGAGCCAGAAACTGAGAAAGAGCAGCGCCTTGTCAGTTTCAGCCCAGCAAGCAGAGGTAGAGCAAACAGAGACGAAATTAGAAACGGAGAGCACAACGACGAAGCAGCCGGGCATGACCACGCCGCGGCCAGCGGAGAAGCAGGTGAACGTTCAGAGCAAGAACATGGGGAAGGAATACGGCGGGCAGTGGCTGAGCAGCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795666.1
MAAASSAYAGFSMRPWRSSRSQKLRKSSALSVSAQQAEVEQTETKLETESTTTKQPGMTTPRPAEKQVNVQSKNMGKEYGGQWLSSTTRHVRIFAAYIDPETCEFDQTQMDKLTLILDPTDEFVWTDETCTKVYSYFQELVDHYEGAPLTEYTLRLIGSDIEHYIRKLLFQGEIKYNMDARVLNFSMGKPRVGFSYDGQLPDAY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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