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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002801`

染色体: Chr02 坐标: 48097692-48098156 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002801`
名称	SmilChr02G002801
描述	uncharacterized SmilChr02G002801
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48097692 - 48098156 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011831`
GeneID	`131011831`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011831`
原始查询	`LOC131011831`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824332]; symbol=AT3G51690; hit=AT3G51690; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824332]; symbol=AT3G51690; hit=AT3G51690; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G51690` (AT3G51690) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824332] identity=47.7; qcov=1.01; evalue=2.22e-47; confidence=medium
Rice	`Os04g0206200` - identity=50; qcov=0.974; evalue=1.83e-45; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011831

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057795691.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057795691.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057795691.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795691.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795691.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48097743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr2:48097745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C62
`Chr2:48097760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B45,C73
`Chr2:48097762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B124,B45,C25,C73
`Chr2:48097776`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A18,B104,B129,B135,B24,B42,B53,B88,C35,C48,C6,D7
`Chr2:48097793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C51
`Chr2:48097811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B83,C40,C70,C76,C8
`Chr2:48097838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C4
`Chr2:48097859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr2:48097864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C81,D7
`Chr2:48097901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,A21,B130,B40
`Chr2:48097925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B94,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795691.1

154 aa

154

Pif1_2B_dom

PF21530 Pif1_2B_dom 1-37 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795691.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	1	37	1.5e-18	66.9	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939708.1
GTTCCAAACCATGAGCTGTACTTGAAGGTGGGAACTCCTGTTATGTTGTTGAGAAACATTGACCATGCAAATGGATTATGTAATGGCACCCGATTAATGATTACAAGACTTGGTAACCATGTTTTGGAAGCAAAGATCTTGACAGGAGATAATGTAGAAGAAAGAGTATTGATTCCAAGAATGACGCTCACTCCGGCAGATCCAAGATTGCCTTTTAAGTTCCAGCGGCGTCAATTTCCTCTAATTGTTTCGTACGCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011831
GTTCCAAACCATGAGCTGTACTTGAAGGTGGGAACTCCTGTTATGTTGTTGAGAAACATTGACCATGCAAATGGATTATGTAATGGCACCCGATTAATGATTACAAGACTTGGTAACCATGTTTTGGAAGCAAAGATCTTGACAGGAGATAATGTAGAAGAAAGAGTATTGATTCCAAGAATGACGCTCACTCCGGCAGATCCAAGATTGCCTTTTAAGTTCCAGCGGCGTCAATTTCCTCTAATTGTTTCGTACGCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795691.1
VPNHELYLKVGTPVMLLRNIDHANGLCNGTRLMITRLGNHVLEAKILTGDNVEERVLIPRMTLTPADPRLPFKFQRRQFPLIVSYAMTINKSQGQSLSHVGFFLPKPVFTHGQLYVAISRVRSRSGLKIFISDEDSGDGTTTTNVVYKEVFQNL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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