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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002817`

染色体: Chr02 坐标: 48266284-48268490 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002817`
名称	SmilChr02G002817
描述	uncharacterized SmilChr02G002817
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48266284 - 48268490 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011844`
GeneID	`131011844`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011844`
原始查询	`LOC131011844`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DPP6 N-terminal domain-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838770]; symbol=AT1G21680; hit=AT1G21680; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DPP6 N-terminal domain-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838770]; symbol=AT1G21680; hit=AT1G21680; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G21680` (AT1G21680) DPP6 N-terminal domain-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838770] identity=60.8; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0840200` - identity=57.4; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07676 (PD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011844

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057795701.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795701.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795701.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795701.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795701.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48266403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B31,B58,C64,C66
`Chr2:48266751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:48266868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:48266898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr2:48266916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr2:48266924`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B10
`Chr2:48266924`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B10
`Chr2:48267123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B44,B49
`Chr2:48267144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C82,D11,D8
`Chr2:48267672`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A14,A20,B79,B84,C36,C43,C71
`Chr2:48267692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B35,B45,C12,C54
`Chr2:48267750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795701.1

686 aa

343

686

PD40

PF07676 PD40 474-600 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795701.1`	Pfam	`PF07676`	PD40	Repeat	474	600	2e-32	113.2	TolB beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939718.1
ATGAAATTCTCCATTTCTTGCTTCCTCGTCATCAATTTTCTACTATTATCACCCCTGTTTCCACTCCTGCACGCGCTCGACTCCATATCCTTCACCACTCTCGGAAGATCAAGCTACGCCTTCGACATATTCGCCCTCCCCGCAGCCGCCCCGCCCCAAGAAATCCGCCTCACTGATGGCAACTCCGTCAATTTCAACGGCCATTTCCCGCCCCCCGCATCCCTCTCGGGTCGACCCGACCCGAATACCCAACTCATCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011844
ATGAAATTCTCCATTTCTTGCTTCCTCGTCATCAATTTTCTACTATTATCACCCCTGTTTCCACTCCTGCACGCGCTCGACTCCATATCCTTCACCACTCTCGGAAGATCAAGCTACGCCTTCGACATATTCGCCCTCCCCGCAGCCGCCCCGCCCCAAGAAATCCGCCTCACTGATGGCAACTCCGTCAATTTCAACGGCCATTTCCCGCCCCCCGCATCCCTCTCGGGTCGACCCGACCCGAATACCCAACTCATCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795701.1
MKFSISCFLVINFLLLSPLFPLLHALDSISFTTLGRSSYAFDIFALPAAAPPQEIRLTDGNSVNFNGHFPPPASLSGRPDPNTQLIYVTERNGSSKIYLDVLLHTRAGSRAALEVSTESTRSQLVLIGDEQTNGRVSMKDRPSLVGHNLIYISTHEDPGKPRSSWTAVYSTELTTGSTRRLTPQGIADYSPAVSPSGLLTAVASYGEKGWSGDVEELGTDIYVFSTRDGSGRVRIIEHGGWPSWADDSTLYFHRRCEDGW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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