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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002827`

染色体: Chr02 坐标: 48367998-48374577 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002827`
名称	SmilChr02G002827
描述	beta-galactosidase 16
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48367998 - 48374577 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011854`
GeneID	`131011854`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011854`
原始查询	`LOC131011854`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-galactosidase 16
产物	beta-galactosidase 16
Arabidopsis	`AT1G77410` (BGAL16) beta-galactosidase 16 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844078] identity=62.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0428100` (OsBgal6) - identity=56; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004565 (beta-galactosidase activity); GO:0005618 (cell wall); GO:0005773 (vacuole); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF01301 (Glyco_hydro_35); PF02140 (SUEL_Lectin); PF17834 (GHD); PF21467 (BetaGal_gal-bd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011854

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057795715.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057795715.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057795715.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795715.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795715.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48368007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C5,D8
`Chr2:48368074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A9,D1
`Chr2:48368714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A9,D1
`Chr2:48368760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr2:48368887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C5,D8
`Chr2:48368922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A9,C27,C28,D1
`Chr2:48368954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:48368968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr2:48369028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:48369144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr2:48369173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C43,D9
`Chr2:48369193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795715.1

789 aa

394

789

Glyco_hydro_35

GHD

BetaGal_gal-bd

SUEL_Lectin

PF01301 Glyco_hydro_35 18-325 aa PF17834 GHD 348-404 aa PF21467 BetaGal_gal-bd 594-659 aa PF02140 SUEL_Lectin 711-788 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795715.1`	Pfam	`PF01301`	Glyco_hydro_35	Domain	18	325	5.7e-109	365.3	Glycosyl hydrolases family 35
`XP_057795715.1`	Pfam	`PF17834`	GHD	Domain	348	404	2e-24	85.8	Beta-sandwich domain in beta galactosidase
`XP_057795715.1`	Pfam	`PF21467`	BetaGal_gal-bd	Domain	594	659	2.5e-29	101.9	Beta-galactosidase, galactose-binding domain
`XP_057795715.1`	Pfam	`PF02140`	SUEL_Lectin	Domain	711	788	1.4e-19	70.9	D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939732.1
ATGGCAGTGGTGGCAGCAAGTGGCGGCGGCGAGGTGGCGTATGATGGAAGGTCGCTCATCATTAATGGACAGCGGAAGCTTCTCTTCTCTGGCTCTATTCATTATACAAGAAGCACGCCTCATATGTGGCCATATTTGATATCACAAGCCAAATTGGGAGGACTAGATGCGATTGATACCTACGTATTTTGGAATATCCACGAGCCCCAACCAGGACAGTATTATTTCAGCGGAAGACGTGATATAGTGAGATTTATCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011854
ATGGCAGTGGTGGCAGCAAGTGGCGGCGGCGAGGTGGCGTATGATGGAAGGTCGCTCATCATTAATGGACAGCGGAAGCTTCTCTTCTCTGGCTCTATTCATTATACAAGAAGCACGCCTCATATGTGGCCATATTTGATATCACAAGCCAAATTGGGAGGACTAGATGCGATTGATACCTACGTATTTTGGAATATCCACGAGCCCCAACCAGGACAGTATTATTTCAGCGGAAGACGTGATATAGTGAGATTTATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795715.1
MAVVAASGGGEVAYDGRSLIINGQRKLLFSGSIHYTRSTPHMWPYLISQAKLGGLDAIDTYVFWNIHEPQPGQYYFSGRRDIVRFIKEVQSQGLYVCLRIGPFIEAEWSYGGLPLWLHDIPGIVFRSDNEPFKFYMQNFTTKIVNMMKSEKLYASQGGPIILSQIENEYQNVEKGFGNKGPPYVRWAATMAVGLKTGVPWVMCKQDDAPDPVINACNGRTCGETFVGPNSPNKPAMWTEHWTHFYDIYGNITKVRSPQFI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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