当前解析结果
SmilChr02G002844| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002844 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002844 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002844 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 48578082 - 48580292 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131011867 |
|---|---|
| GeneID | 131011867 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011867 |
| 原始查询 | LOC131011867 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os02g0328500- identity=27.8; qcov=0.492; evalue=6.47e-17; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011867 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057795733.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795733.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795733.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057795733.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057795733.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:48579045 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B64 |
Chr2:48579050 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D9 |
Chr2:48579068 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B73,B90,C69 |
Chr2:48579092 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C34 |
Chr2:48579092 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C34 |
Chr2:48579097 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A16,C30 |
Chr2:48579165 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B1,B45,B93,C1,C87 |
Chr2:48579179 |
C |
CG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B104,B108,B115,C61 |
Chr2:48579179 |
C |
CG |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | B104,B108,B115,C61 |
Chr2:48579187 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B73 |
Chr2:48579190 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B61,B72,B73 |
Chr2:48579215 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B62,C50,D3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。