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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004852`

染色体: Chr01 坐标: 66682128-66683678 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004852`
名称	SmilChr01G004852
描述	uncharacterized SmilChr01G004852
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	66682128 - 66683678 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011875`
GeneID	`131011875`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011875`
原始查询	`LOC131011875`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836564]; symbol=AT5G64430; hit=AT5G64430; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836564]; symbol=AT5G64430; hit=AT5G64430; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G64430` (AT5G64430) Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836564] identity=41.3; qcov=0.994; evalue=4.72e-90; confidence=medium
Rice	`Os11g0444700` (OsPB1) - identity=47.6; qcov=0.2; evalue=6.5e-29; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00564 (PB1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011875

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057795749.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057795749.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795749.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795749.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795749.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:66682183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:66682243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C15,C21
`Chr1:66682596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr1:66682599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr1:66682680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr1:66682725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:66682755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr1:66682937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,A23,B89,C34,C39
`Chr1:66683154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,B78
`Chr1:66683163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,A9,C45
`Chr1:66683352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:66683430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795749.1

516 aa

258

516

PB1

PF00564 PB1 60-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795749.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	60	147	1e-17	64.5	PB1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939766.1
ATGGAGAACTACTCCTACAACTCCTCCTACCCCGAGTCCGGCGACTCCTCGCCGCGCTCTCGCGAGATCGACTTCGAGAATCCGCCGCCCTGGGAGGATTCGCAGGGGAATCAGCCGCTCCCTAATTATAAGGTCAAGTTTATGTGCAGCTACGGTGGGAAGATTCACCCGCGGCCGCACGATAACCAGCTCTCGTACATCGGAGGCGAGACGAAGATCCTCTCAGTCGATCGCAACATTAAATTCGGCTCTCTGCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011875
ATGGAGAACTACTCCTACAACTCCTCCTACCCCGAGTCCGGCGACTCCTCGCCGCGCTCTCGCGAGATCGACTTCGAGAATCCGCCGCCCTGGGAGGATTCGCAGGGGAATCAGCCGCTCCCTAATTATAAGGTCAAGTTTATGTGCAGCTACGGTGGGAAGATTCACCCGCGGCCGCACGATAACCAGCTCTCGTACATCGGAGGCGAGACGAAGATCCTCTCAGTCGATCGCAACATTAAATTCGGCTCTCTGCTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795749.1
MENYSYNSSYPESGDSSPRSREIDFENPPPWEDSQGNQPLPNYKVKFMCSYGGKIHPRPHDNQLSYIGGETKILSVDRNIKFGSLLPKLIALCDNENISFKYQLPGEDLDALISVTNDDDLEHMMHEYERLYRISPKPARLRIFIFPTLNQSLSSSTRSFGSDSEVKSEKERFVEALNSAPIITAPPHTVSAAAPQPQAQALLQPPASNMDFLFGLEKANAMAAAAVQPPVQQPMMGRVPEMEDPVFLPGQDERSMGLDP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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