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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002856`

染色体: Chr02 坐标: 48764794-48768703 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002856`
名称	SmilChr02G002856
描述	chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48764794 - 48768703 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011880`
GeneID	`131011880`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011880`
原始查询	`LOC131011880`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic-like
产物	chlorophyllide a oxygenase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G44446` (CH1) Pheophorbide a oxygenase family protein with Rieske 2Fe-2S domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841029] identity=74.8; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0567400` (CAO) - identity=77; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0009507 (chloroplast); GO:0010277 (chlorophyllide a oxygenase activity); GO:0015995 (chlorophyll biosynthetic process); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding)
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00355 (Rieske); PF08417 (PaO); PF19112 (VanA_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011880

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057795750.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057795750.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057795750.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057795750.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795750.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48768157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr2:48768274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B63,B83,C76
`Chr2:48768279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,C2,C32,C68,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795750.1

539 aa

270

539

Rieske

VanA_C

PaO

PF00355 Rieske 219-300 aa PF19112 VanA_C 352-522 aa PF08417 PaO 406-500 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795750.1`	Pfam	`PF00355`	Rieske	Domain	219	300	2.5e-24	85.7	Rieske [2Fe-2S] domain
`XP_057795750.1`	Pfam	`PF19112`	VanA_C	Domain	352	522	6.2e-16	59.8	Vanillate O-demethylase oxygenase C-terminal domain
`XP_057795750.1`	Pfam	`PF08417`	PaO	Family	406	500	8.7e-18	65.0	Pheophorbide a oxygenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939767.1
GAGAAGAAGTAGAATTATGAGATAGGGTGTGTGGTGTGGGAAAGCGAAGGGAGGCTGAATCGAAGCTCAGTCCACGTGGCAGCCTCTAGAAGGCATGCCGAGATCGCGCGAAATACCGACCTCTTATCCATTAATTAATCTCTCTCACTAAAACTACTCTGTTTTCCTTTCTCTCTCTCCTGGGCCCGACCCGTTTTCTGCCATGTCCGCCATTGCTACTGCTGCTGCTCTTTCTCTTCCCATCTCCCTTTCTCGATCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011880
ATGTCCGCCATTGCTACTGCTGCTGCTCTTTCTCTTCCCATCTCCCTTTCTCGATCCAACAACTTTCACGCCAGAAAGTGTCTCAGGGGAGGGGTTGGGGTATTTGCTATCATTGGAGAGGAAGGTGGGCTGGTTGAGAGGAAAAGCCCTTGGACTTCACTCTTTGATGTGGAAGATCCGCGGTTGAAGGTCCCTCAGTATAAAGGCAAGTTTCTCGACGTGAATCAAGCTCTAGAGGTGGCTAGATATGACATACAATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795750.1
MSAIATAAALSLPISLSRSNNFHARKCLRGGVGVFAIIGEEGGLVERKSPWTSLFDVEDPRLKVPQYKGKFLDVNQALEVARYDIQYCDWKARQDVLTIMLLHEKVVEVLNPLAREFKSIGTLRKELAELQEALAQAHNQVHISEARVSTALDKLAYMETLVTDKILQDRNTTGSELLLPTPSTSSSPSLAPAKSRQPKRSINVSGPVQPYNDHLKNFWYPVAFSAGLKDDTMMPIDCFEEPWVLFRGKDGKPGCVQNTC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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