当前解析结果
SmilChr01G000364| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000364 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000364 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000364 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 7539047 - 7539838 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131011894 |
|---|---|
| GeneID | 131011894 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011894 |
| 原始查询 | LOC131011894 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0599900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os12g0599900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0599900- identity=34.9; qcov=0.761; evalue=2.74e-10; confidence=low |
| GO | GO:0005515 (protein binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00023 (Ank); PF13606 (Ank_3) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011894 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057795809.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057795809.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057795809.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795809.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795809.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057795809.1PF13606
Ank_3 59-87 aa
PF00023
Ank 59-88 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057795809.1 |
Pfam | PF13606 |
Ank_3 | Repeat | 59 | 87 | 5e-05 | 24.1 | Ankyrin repeat |
XP_057795809.1 |
Pfam | PF00023 |
Ank | Repeat | 59 | 88 | 0.00011 | 23.1 | Ankyrin repeat |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。