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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002871`

染色体: Chr02 坐标: 48893646-48905264 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002871`
名称	SmilChr02G002871
描述	uncharacterized SmilChr02G002871
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	48893646 - 48905264 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011898`
GeneID	`131011898`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011898`
原始查询	`LOC131011898`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844097]; symbol=AT1G77620; hit=AT1G77620; species=arabidopsis; confidence=low
产物	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844097]; symbol=AT1G77620; hit=AT1G77620; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G77620` (AT1G77620) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844097] identity=31.8; qcov=0.914; evalue=1.4e-139; confidence=low
Rice	`Os03g0262300` - identity=32.6; qcov=0.43; evalue=2.15e-78; confidence=low
GO	GO:0000077 (DNA damage checkpoint signaling); GO:0003682 (chromatin binding); GO:0006281 (DNA repair); GO:0033314 (mitotic DNA replication checkpoint signaling)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011898

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795778.1`
2	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057795778.1`
3	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057795780.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057795778.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795778.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:48893758`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A13,B100,B108,B11,B137,B14,B22,B27,B41,B66,B76,C23,C24,C25,C3,C44,C49,C55,C57,C61,C70,C71,C73,D10
`Chr2:48894210`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B35
`Chr2:48894210`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B35
`Chr2:48894523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr2:48894952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,C25,C28,C61
`Chr2:48895799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C62,C85
`Chr2:48895929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr2:48896031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:48896748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C34
`Chr2:48897223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B3
`Chr2:48897343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B131,C87
`Chr2:48900210`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B129,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939795.1
TTATATGGTATTTTTCACTTTCCTTCCCCCACAAAAAACGATATTTACCTTTGACACCCAGTTCCACAATACAAAATCTTTTACTATCTGTTTCACCACAACCCTTCTTCAATTCCAATTCCAATTCCAATTCTCTCCAACTAATAGCTTCAAAAACAGGGGCCAAATTTGGAGCCCTAATTCAGCTATGGAGGGGAAGGACGTGAAGCGACGATTGGTTCAGTCGACGCTGTTTCCTCACAAGGAGACTGCAATTAAGG...

XM_057939796.1
TATATGGTATTTTTCACTTTCCTTCCCCCACAAAAAACGATATTTACCTTTGACACCCAGTTCCACAATACAAAATCTTTTACTATCTGTTTCACCACAACCCTTCTTCAATTCCAATTCCAATTCCAATTCTCTCCAACTAATAGCTTCAAAAACAGGGGCCAAATTTGGAGCCCTAATTCAGCTATGGAGGGGAAGGACGTGAAGCGACGATTGGTTCAGTCGACGCTGTTTCCTCACAAGGAGACTGCAATTAAGGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131011898
ATGGTATTTTTCACTTTCCTTCCCCCACAAAAAACGATATTTACCTTTGACACCCAGTTCCACAATACAAAATCTTTTACTATCTGTTTCACCACAACCCTTCTTCAATTCCAATTCCAATTCCAATTCTCTCCAACTAATAGCTTCAAAAACAGGGGCCAAATTTGGAGCCCTAATTCAGCTATGGAGGGGAAGGACGTGAAGCGACGATTGGTTCAGTCGACGCTGTTTCCTCACAAGGAGACTGCAATTAAGGCCGG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057795778.1
MVFFTFLPPQKTIFTFDTQFHNTKSFTICFTTTLLQFQFQFQFSPTNSFKNRGQIWSPNSAMEGKDVKRRLVQSTLFPHKETAIKAGENCGADREEAVVQEDEDEDEEWCGSSKKRRGTKKKGNSKQKTTPRASAKKDIENGKGTPTKQVKDSDSPVIPKSSFFVKVSEQRRPKRQQSQLISAESPEENGDICSVPSSVENCRTTPHKQKQRGKSTPRKEKRSSTPSKKMKSGKRELQFDHIPCDLPPDEQPMHKLPDLR...

XP_057795779.1
MVFFTFLPPQKTIFTFDTQFHNTKSFTICFTTTLLQFQFQFQFSPTNSFKNRGQIWSPNSAMEGKDVKRRLVQSTLFPHKETAIKAGENCGADREEAVVQEDEDEDEEWCGSSKKRRGTKKKGNSKQKTTPRASAKKDIENGKGTPTKQVKDSDSPVIPKSSFFVKVSEQRRPKRQQSQLISAESPEENGDICSVPSSVENCRTTPHKQKQRGKSTPRKEKRSSTPSKKMKSGKRELQFDHIPCDLPPDEQPMHKLPDLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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