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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002880`

染色体: Chr02 坐标: 49058969-49064452 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002880`
名称	SmilChr02G002880
描述	uncharacterized SmilChr02G002880
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49058969 - 49064452 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011907`
GeneID	`131011907`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011907`
原始查询	`LOC131011907`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	YbaK/aminoacyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841048]; symbol=AT1G44835; hit=AT1G44835; species=arabidopsis; confidence=high
产物	YbaK/aminoacyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841048]; symbol=AT1G44835; hit=AT1G44835; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G44835` (AT1G44835) YbaK/aminoacyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841048] identity=59.5; qcov=1; evalue=3.45e-128; confidence=high
Rice	`Os02g0767700` (OsERF#126) - identity=54.6; qcov=0.981; evalue=2.38e-112; confidence=high
GO	GO:0002161 (aminoacyl-tRNA deacylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04073 (tRNA_edit)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011907

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795789.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057795789.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057795789.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795789.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795789.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49059953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:49060054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:49060097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:49063776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,B41,B50,C18
`Chr2:49064072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B44,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795789.1

321 aa

160

321

tRNA_edit

PF04073 tRNA_edit 24-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795789.1`	Pfam	`PF04073`	tRNA_edit	Family	24	151	1.4e-27	96.9	Aminoacyl-tRNA editing domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939806.1
AATTACGTAAAAGATTAAATTGAAAAGGAGACAAGACAAGGGCAAGGTTGAACACTTTCATTCCGGTGGAGGGTATTATTGGAAACTTCCAATATAAACAAAATGAAATATTTTTGCCCTCTCTCTCGACTGAAATAACACTGCAAATTTCGCACCGCCGCTTTGAGAAAAATCTACCCGGCGCTTCATCGGAGGAGAGATGGCTTTCACGAAAGAGCAGCTCCTTGCACGTTTACAGGAGCTTCAAATAGGTTTCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011907
ATGGCTTTCACGAAAGAGCAGCTCCTTGCACGTTTACAGGAGCTTCAAATAGGTTTCTCCCAGTACGAGCATCCTGTTGTATTGACAGTGGAAGCTCAGGCGAAGTATGTTGGGAACATGAAAGGTGCACTGAGCAAGAATTTGTTCTTGAAGGACAAGAAACAAAGATATTATATTGTTTCTGCTTTGGCGGACACAAAGGTAGATCTCAAAGTTCTGTCTCAGAGACTTGGTCTGGGAAAAGGAGGTGTTAGAATGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795789.1
MAFTKEQLLARLQELQIGFSQYEHPVVLTVEAQAKYVGNMKGALSKNLFLKDKKQRYYIVSALADTKVDLKVLSQRLGLGKGGVRMAPEEALSEILHVPLGCVTPFALVNESARHVSLLLDKGFKSQECCFFHPLSNDMSIALNAHDLDKFLNSIGKPPAYVDLEATPTVGKDQPPDLASLVPSDASVSADPPVKQESSQGPNKNHISADNQPVITAGAKPAKPSSASTKEKPSGAVNMSITYADPDKFVEEILEKTRTR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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