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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002884`

染色体: Chr02 坐标: 49126854-49128567 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002884`
名称	SmilChr02G002884
描述	protein NODULATION SIGNALING PATHWAY 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49126854 - 49128567 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011911`
GeneID	`131011911`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011911`
原始查询	`LOC131011911`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NODULATION SIGNALING PATHWAY 2-like
产物	protein NODULATION SIGNALING PATHWAY 2-like
Arabidopsis	`AT4G08250` (AT4G08250) GRAS family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826375] identity=53.8; qcov=0.996; evalue=1.9e-170; confidence=high
Rice	`Os03g0263300` (NSP2) - identity=53.6; qcov=1.01; evalue=3.84e-162; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011911

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795792.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795792.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795792.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795792.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795792.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49127237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B42,B43,B70,C7
`Chr2:49127373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,C72
`Chr2:49127378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C58
`Chr2:49127598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C72
`Chr2:49127643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:49127694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr2:49127718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:49127727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B140,B84,C62,C79
`Chr2:49127741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,C12,C19,C41,C79
`Chr2:49127824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:49127892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:49127904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795792.1

491 aa

246

491

GRAS

PF03514 GRAS 112-485 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795792.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	112	485	1.8e-105	353.7	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939809.1
AGTAGATTCATACACTCCCTTTCAATCTCACAATAAACACTCATAGCTACAAAAAATAAAATCATATTTGTGAATTTAATCCACGTCTAAATTAGCCATGGCAATGGTGATGGACCTCGGTTTTCTTAGTTATGATGATTATAGTGCCATGGACGCGGTCACAACCACGACCACGACCACCACCAGCACCACCACGACCACGACCTCGTCCACCGACGAGGGGTGCAATTGGAACGACTGGTCGCCGGTGGTGGACTGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011911
ATGGCAATGGTGATGGACCTCGGTTTTCTTAGTTATGATGATTATAGTGCCATGGACGCGGTCACAACCACGACCACGACCACCACCAGCACCACCACGACCACGACCTCGTCCACCGACGAGGGGTGCAATTGGAACGACTGGTCGCCGGTGGTGGACTGGGAGGCGCTCTCCGGCGACCAGGAAGACTTCCAAAACCTCATAGATTCAATGATTGATGAGAATAATGTGGTGTTGCAACAATCCATTAGGCCAAGTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795792.1
MAMVMDLGFLSYDDYSAMDAVTTTTTTTTSTTTTTTSSTDEGCNWNDWSPVVDWEALSGDQEDFQNLIDSMIDENNVVLQQSIRPSYVHEEYNNQSPEYNMATDEDSKGLRLIHLLMAAAEAMAGANKCRELARVILVRLKELVSPTDGTNMERLAAYFTDALQALLDTAAGGAKHALGGGEHHRSDVLAAFQLLQDMSPYVKFGHFTANQAILEAVAHDRRVHIVDYDIMEGIQWASLMQALVSRKDGPPAPHLRITAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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