当前解析结果
SmilChr02G002885| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002885 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002885 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002885 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 49159389 - 49161358 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011912 |
|---|---|
| GeneID | 131011912 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011912 |
| 原始查询 | LOC131011912 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | histone-lysine N-methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826374]; symbol=AT4G08240; hit=AT4G08240; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | histone-lysine N-methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826374]; symbol=AT4G08240; hit=AT4G08240; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT4G08240 (AT4G08240)histone-lysine N-methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826374] identity=38.6; qcov=1.27; evalue=2.7e-20; confidence=low |
| Rice | Os02g0567000- identity=42; qcov=0.81; evalue=4.28e-09; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011912 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057795793.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057795793.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057795793.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795793.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795793.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:49159803 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B50,C53,C70 |
Chr2:49159807 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr2:49161282 |
A |
ATC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 21 | A3,A4,A7,B121,B13,B131,B137,B2,B29,B47,B6,B77,B87,B99,C46,C50,C52,C65,C67,C80,C81 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。