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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002895`

染色体: Chr02 坐标: 49223768-49231532 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002895`
名称	SmilChr02G002895
描述	flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49223768 - 49231532 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011922`
GeneID	`131011922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011922`
原始查询	`LOC131011922`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase-like
产物	flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase-like
Arabidopsis	`AT5G08640` (FLS1) flavonol synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830765] identity=56.9; qcov=1.03; evalue=1.46e-133; confidence=high
Rice	`Os02g0767300` (FLS) - identity=52.9; qcov=1.02; evalue=3.48e-123; confidence=high
GO	GO:0009416 (response to light stimulus); GO:0045431 (flavonol synthase activity)
KEGG	smil00941 (Flavonoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795806.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057795806.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795806.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795806.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795806.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49224042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr2:49224079`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B70
`Chr2:49224079`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B70
`Chr2:49224097`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B139,B22
`Chr2:49224097`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B139,B22
`Chr2:49224117`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B58
`Chr2:49224117`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B58
`Chr2:49224197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:49224218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr2:49224232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:49226001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:49226019`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795806.1

323 aa

162

323

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 38-115 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 189-284 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795806.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	38	115	2.4e-18	67.6	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057795806.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	189	284	3.2e-31	108.4	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939823.1
TTATAATTCCTTCCACCAATCCTATAAGTAACATGCGATGGACATGACGCAAAGTTGTTATTTCTGTTTTTCTGTTTTACTATACCACCACCATGTAAGATCACTTTGACTTTTTTCTTCCATCCCCAAAACACAAACAAAAATTAAGTCAATACATACGATTGCAATAGAAGAAATTAAAATGGAAAAAGTGCAAAGTAATGTTGCGGGCCTATGCGAATTGCCGGCGGAGTTCATCCGGCCGGAGGCGGAGCAGCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011922
ATGGAAAAAGTGCAAAGTAATGTTGCGGGCCTATGCGAATTGCCGGCGGAGTTCATCCGGCCGGAGGCGGAGCAGCCCCGCTTCACCACGTTCGAGGGGGCGGATGCGGAGGTGCCGGTGGTTGATTTCGGCGGCGAGTGGGAAACGGTGGTGAAGGCGGTTTGCGAGGCGAGCAGCAAATGGGGGTTATTCCAGATTGTGAACCACAGCATCTCCGGCGAAGTTATAGACAATTTACAGAGGGTTGGGCGGCTGTTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795806.1
MEKVQSNVAGLCELPAEFIRPEAEQPRFTTFEGADAEVPVVDFGGEWETVVKAVCEASSKWGLFQIVNHSISGEVIDNLQRVGRLFFELPNEEKTAYARDPESKSLDGYGSRLRNGWVDHLFNKIWPPNAVDYRFWPKTPPDYREVTEEYGKNLQEVVEKLLGCLSLGLGLGVEELKTAVGGEELVYNLKINYYPPCPRPDLVLGVPAHTDLSALTILVPNQVQGLQVFRDQHWYNVSYIPNALIIHIGDQIEILSNGKY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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