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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002941`

染色体: Chr02 坐标: 49912215-49914291 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002941`
名称	SmilChr02G002941
描述	uncharacterized SmilChr02G002941
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	49912215 - 49914291 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011961`
GeneID	`131011961`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011961`
原始查询	`LOC131011961`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0690100; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os04g0690100; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G75710` (AT1G75710) C2H2-like zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843905] identity=44.6; qcov=1.12; evalue=2.67e-99; confidence=medium
Rice	`Os04g0690100` - identity=58.8; qcov=0.72; evalue=4.59e-106; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011961

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057795849.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057795849.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795849.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795849.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795849.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:49912526`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B118,B20,B67,B87,C35,C40,C78,D4,D9
`Chr2:49912688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B77,C47,D9
`Chr2:49912767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B129,B21,B65
`Chr2:49912790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:49913969`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B107
`Chr2:49913969`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B107
`Chr2:49914154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939866.1
GTTCGATTCCACAATGGGGTAAACATTAATTTCTTCCCAACAATTCCTGGTACAGAATTGAATTGTACACATAAAAGGCAAAGCATTACTATTATGTAAACACACACACACACACACACATAGAGAGAGAGATTTAAGCTCAATGTAAAGGGAGAAGCAATTCATCTCATCTCCTCTCCTTATTTACTCACTCTTCCACCCTCTGTAAAAAGTGCATGTTTGTAGTCACTTTCTTGAAATAAAAACAGACAAAACTCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011961
ATGGCCAAAAGCAGAAAGCAGAGCAGAGAGAAAAAAAAACAGGAAGAATATGAGAAACCCCATTCATGGGCAGCTGTTCGAAGCCTCTTCACCTGCAAGTACCTCCAGGTACAACACCAGCAGCACCTGGTACACCTCCAAGAACCCAAGCCGAAAGAGATAACAAACAGCAGCAAGAAGATGAAGTGCTCGGGCTCCCTCTGCAGCAACACCAAAGTCATGCAGAAGCCAGAGATCATCTCCGCATCTCCCAACAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795849.1
MAKSRKQSREKKKQEEYEKPHSWAAVRSLFTCKYLQVQHQQHLVHLQEPKPKEITNSSKKMKCSGSLCSNTKVMQKPEIISASPNKKRAAAHLSSSESDASSRSLIKAAASPSVRSMPFRKLSGCYECRMVVDPVLGMTRDPSLRATISSCPQCGQVFMKPENLELHQAVRHAVCELGAEDTSKNIVEIIFQSSWLKKQAPVCKIERILKVQNSPKTISKFEEYRDSIKGKANPKKQQPRCAADGNELLRFHCTTLMCSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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