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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002952`

染色体: Chr02 坐标: 50062262-50064431 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002952`
名称	SmilChr02G002952
描述	ubiquitin-fold modifier 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	50062262 - 50064431 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011966`
GeneID	`131011966`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011966`
原始查询	`LOC131011966`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-fold modifier 1
产物	ubiquitin-fold modifier 1
Arabidopsis	`AT1G77710` (CCP2) ubiquitin-fold modifier [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844107] identity=83.5; qcov=1; evalue=1.9e-43; confidence=medium
Rice	`Os01g0962400` - identity=81.9; qcov=0.976; evalue=1.33e-41; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:1990592 (protein K69-linked ufmylation)
KEGG	-
Pfam	PF03671 (Ufm1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011966

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057795852.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057795853.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057795852.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795852.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795852.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:50062504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:50063986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr2:50064219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795852.1

96 aa

Ufm1

PF03671 Ufm1 12-92 aa

XP_057795853.1

85 aa

Ufm1

PF03671 Ufm1 12-81 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795852.1`	Pfam	`PF03671`	Ufm1	Domain	12	92	2e-44	150.2	Ubiquitin fold modifier 1 protein
`XP_057795853.1`	Pfam	`PF03671`	Ufm1	Domain	12	81	8.4e-32	109.8	Ubiquitin fold modifier 1 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939869.1
TTTGGGAACTTTCACTCATGGTACAACTACAAGTAAAGTGGAGGAAAAGAAAAAAAACACGCAAGTCCTAAATTAAAGTAGATTGACACGTGGCTGTTTTATATTGGCTGGATATACCTGCGCGTATGTAGCAAGCAGTTGATATTGCACATATAATCTTCAAAATTACTGAAAAATAAGAAAAAAGATTTAAATACGAAAGAGATGGCGAGCGGTGGCGCCGGCGGCGGAGGTGGCGGAAAGGTGTCGTTCAAAGTTAC...

XM_057939870.1
CAAGCAGTTGATATTGCACATATAATCTTCAAAATTACTGAAAAATAAGAAAAAAGATTTAAATACGAAAGAGATGGCGAGCGGTGGCGCCGGCGGCGGAGGTGGCGGAAAGGTGTCGTTCAAAGTTACTCTTACCTCTGATCCGAAACTCCCATTCAAAATATTTAGCGTACCGGAGGCTGCCCCTTTTACTGCAGTTCTGAAATTCGCCGCCGAGGAATTTAAAGTGCCCCCCCAAACCAGTGCCATCATCACTAACG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011966
ATGGCGAGCGGTGGCGCCGGCGGCGGAGGTGGCGGAAAGGTGTCGTTCAAAGTTACTCTTACCTCTGATCCGAAACTCCCATTCAAAATATTTAGCGTACCGGAGGCTGCCCCTTTTACTGCAGTTCTGAAATTCGCCGCCGAGGAATTTAAAGTGCCCCCCCAAACCAGTGCCATCATCACTAACGGAAATGTCTTTCTTAAACATGGCTCAGAGCTGCGCTTAATTCCCCGCGACAGAGTTGGTGCCTGTATGTAA

LOC131011966
ATGGCGAGCGGTGGCGCCGGCGGCGGAGGTGGCGGAAAGGTGTCGTTCAAAGTTACTCTTACCTCTGATCCGAAACTCCCATTCAAAATATTTAGCGTACCGGAGGCTGCCCCTTTTACTGCAGTTCTGAAATTCGCCGCCGAGGAATTTAAAGTGCCCCCCCAAACCAGTGCCATCATCACTAACGATGGAGTGGGAATCAATCCTCAACAGAGTGCTGGAAATGTCTTTCTTAAACATGGCTCAGAGCTGCGCTTAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795852.1
MASGGAGGGGGGKVSFKVTLTSDPKLPFKIFSVPEAAPFTAVLKFAAEEFKVPPQTSAIITNDGVGINPQQSAGNVFLKHGSELRLIPRDRVGACM

XP_057795853.1
MASGGAGGGGGGKVSFKVTLTSDPKLPFKIFSVPEAAPFTAVLKFAAEEFKVPPQTSAIITNGNVFLKHGSELRLIPRDRVGACM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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