当前解析结果
SmilChr02G002972| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002972 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002972 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002972 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 50265306 - 50267624 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131011983 |
|---|---|
| GeneID | 131011983 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011983 |
| 原始查询 | LOC131011983 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0450500; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os04g0450500; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os04g0450500- identity=39.2; qcov=0.38; evalue=2.2e-30; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011983 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057795873.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057795873.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057795873.1 |
| 4 | Telomere | 端粒 | 0.80000 | XP_057795874.1 |
| 5 | Nuclear body | 核内小体 | 0.80000 | XP_057795874.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:50265657 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A14,B47,C76 |
Chr2:50266399 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B124,C48,C87 |
Chr2:50266399 |
G |
GT |
1bp_insertion | CDS_variant | 3 | B124,C48,C87 |
Chr2:50266492 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C83 |
Chr2:50266511 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B28,B55,C72 |
Chr2:50266756 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B41,C18,C61 |
Chr2:50266771 |
A |
ATT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 6 | B109,B115,B124,C40,C87,D3 |
Chr2:50267304 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C53 |
Chr2:50267348 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C32 |
Chr2:50267439 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B103,B129,B21,B37,B98 |
Chr2:50267439 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B103,B129,B21,B37,B98 |
Chr2:50267515 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B109,B88,C36,C47,C51 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。