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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002983`

染色体: Chr02 坐标: 50415867-50421605 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002983`
名称	SmilChr02G002983
描述	chaperone protein dnaJ A7A, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	50415867 - 50421605 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011996`
GeneID	`131011996`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011996`
原始查询	`LOC131011996`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein dnaJ A7A, chloroplastic-like
产物	chaperone protein dnaJ A7A%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G22360` (AT2G22360) DNAJ heat shock family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816768] identity=70; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0333500` (OsDjA7) - identity=69.7; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009408 (response to heat); GO:0031072 (heat shock protein binding); GO:0042026 (protein refolding); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051085 (GO:0051085)
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF00684 (DnaJ_CXXCXGXG); PF01556 (DnaJ_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011996

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057795886.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057795886.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795886.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795886.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795886.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:50416169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C2
`Chr2:50416239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr2:50416253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,C45,D11
`Chr2:50416269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:50416311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,C72
`Chr2:50416334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B5,B53,C78
`Chr2:50416481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr2:50416544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:50416688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:50416746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B62,C45
`Chr2:50416772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B32,B60
`Chr2:50417429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B93,C62,C72,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795886.1

438 aa

219

438

DnaJ

DnaJ_C

DnaJ_CXXCXGXG

PF00226 DnaJ 80-141 aa PF01556 DnaJ_C 197-412 aa PF00684 DnaJ_CXXCXGXG 222-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795886.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	80	141	2e-28	99.0	DnaJ domain
`XP_057795886.1`	Pfam	`PF01556`	DnaJ_C	Domain	197	412	2.3e-45	155.1	DnaJ C terminal domain
`XP_057795886.1`	Pfam	`PF00684`	DnaJ_CXXCXGXG	Domain	222	285	3.3e-15	56.8	DnaJ central domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939903.1
AGTATATTCGAGGCTTGGGCCAAGTGCACAACGACATAGCCCTAACTATCGGCTATTCTCGAAGGCCCTAATTTCAGTTCACATAACAAAAGTACAGAATAGAAGAAGAACGACCCTATCTCCTAATTTCAGTTCACAGCCGCCACGCGCAGTCGCCGGCAGCCTTCGTCGCGCCTCCGCCCGACGCCAGCAGCTTCGCCTCGCTGCGCGTCCTTCCCACCGCGACGCGCATCCAGTCGTTTCGCGCGCCTCCGCGCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011996
ATGGCGGTCATTCCTTGTGGAAGTATGCAGATTGTGCCGTCGGGAGTTCAGCCTCAGTTCGTTTTCAGATCTTCTGCTGTGAATAGAGTGTCGGCGTCTACTAATTGTTTGTCCAAAAGGGCCGCATCGCTAAGTTCAACAATTTTCTCTCATAAACCCTTGGGTGAACTTTTTGGTTCAGCATCATATGTCAAACCATGCCAGAGAGGTGCCCGCCTTGTTGTTCGAGCTGAACGAGATTACTATTCTGTCCTTGGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795886.1
MAVIPCGSMQIVPSGVQPQFVFRSSAVNRVSASTNCLSKRAASLSSTIFSHKPLGELFGSASYVKPCQRGARLVVRAERDYYSVLGVSKSANKSEIKSAYRKLARNYHPDVNKEPGAEEKFKEISNAYEVLSDDEKRSIYDKYGEAGLKGAGMGMGDFNNPFDIFESLFEGMGGMGGMGMGGRGSRSRATEGEDQVYNLILNFKDAVFGIEKEIEITRLESCSTCDGSGAKPGTSASKCTTCGGQGQVVASTRTPLGVFQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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