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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001787`

染色体: Chr02 坐标: 32640338-32642583 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001787`
名称	SmilChr02G001787
描述	30S ribosomal protein S6 alpha, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	32640338 - 32642583 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012037`
GeneID	`131012037`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012037`
原始查询	`LOC131012037`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	30S ribosomal protein S6 alpha, chloroplastic-like
产物	30S ribosomal protein S6 alpha%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G64510` (AT1G64510) Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842759] identity=64; qcov=0.731; evalue=3.33e-61; confidence=high
Rice	`Os03g0843400` (OSJNBa0032G11.6) - identity=65.5; qcov=0.577; evalue=5.93e-51; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0070181 (small ribosomal subunit rRNA binding)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01250 (Ribosomal_S6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012037

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057795927.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057795927.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795927.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795927.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795927.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:32640780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:32640858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B59,B84,C77
`Chr2:32640965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C45
`Chr2:32641000`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C16
`Chr2:32641000`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C16
`Chr2:32641017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,D10
`Chr2:32642187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr2:32642247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,B93,C71
`Chr2:32642383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A4,B104,B45,B56
`Chr2:32642472`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B82
`Chr2:32642472`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795927.1

201 aa

100

201

Ribosomal_S6

PF01250 Ribosomal_S6 97-195 aa

XP_057795928.1

201 aa

100

201

Ribosomal_S6

PF01250 Ribosomal_S6 97-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795927.1`	Pfam	`PF01250`	Ribosomal_S6	Domain	97	195	2.2e-15	57.3	Ribosomal protein S6
`XP_057795928.1`	Pfam	`PF01250`	Ribosomal_S6	Domain	97	195	2.2e-15	57.3	Ribosomal protein S6

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939945.1
CTTTTTCCCAAAATCGCGTTTAACAAATCAAACGCAGACAACAAATAGATTCGCTAACTAAACCCACTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTTCTGAGAAGCCAACAATGGCAATGGCATCAGCTTCTCTCTCTTCCTCCACTCTCTTCAAATCCAGCACCTCTCACCCTCACTCACCATCTTCCTTCCTTCCTCTCCGCACATCCTTTAAATCCAAAAACTCCATTAAAATCCCGCTTCTGGTAAGCAGCCTAAAA...

XM_057939944.1
CTTTTTCCCAAAATCGCGTTTAACAAATCAAACGCAGACAACAAATAGATTCGCTAACTAAACCCACTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTTCTGAGAAGCCAACAATGGCAATGGCATCAGCTTCTCTCTCTTCCTCCACTCTCTTCAAATCCAGCACCTCTCACCCTCACTCACCATCTTCCTTCCTTCCTCTCCGCACATCCTTTAAATCCAAAAACTCCATTAAAATCCCGCTTCTGGTAAGCAGCCTAAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012037
ATGGCAATGGCATCAGCTTCTCTCTCTTCCTCCACTCTCTTCAAATCCAGCACCTCTCACCCTCACTCACCATCTTCCTTCCTTCCTCTCCGCACATCCTTTAAATCCAAAAACTCCATTAAAATCCCGCTTCTGGTAAGCAGCCTAAAACCCCTGCTGCCGGCGGCAGCCATGAAAGAAGAATTCGACACGTCCATTTTCGCCAACGATTTCGGCGGACCGCCACCGATCGAGGGGTTCAGCGATCTGGAGCCCAAGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795927.1
MAMASASLSSSTLFKSSTSHPHSPSSFLPLRTSFKSKNSIKIPLLVSSLKPLLPAAAMKEEFDTSIFANDFGGPPPIEGFSDLEPKEEPECPPGLRQYETMAILRPNISEDERLAFIHKYEQLLCAGGAMYVEVLNKGVRPLAYSIRKRNKAGETNTYLDSIQILFTFFTKPESISIIGETLQRDDDVIRSSTFKIRKRKY

XP_057795928.1
MAMASASLSSSTLFKSSTSHPHSPSSFLPLRTSFKSKNSIKIPLLVSSLKPLLPAAAMKEEFDTSIFANDFGGPPPIEGFSDLEPKEEPECPPGLRQYETMAILRPNISEDERLAFIHKYEQLLCAGGAMYVEVLNKGVRPLAYSIRKRNKAGETNTYLDSIQILFTFFTKPESISIIGETLQRDDDVIRSSTFKIRKRKY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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