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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005029`

染色体: Chr01 坐标: 68242265-68243029 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005029`
名称	SmilChr01G005029
描述	UPF0496 protein At4g34320-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68242265 - 68243029 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012061`
GeneID	`131012061`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012061`
原始查询	`LOC131012061`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0496 protein At4g34320-like
产物	UPF0496 protein At4g34320-like
Arabidopsis	`AT4G34320` (AT4G34320) transmembrane protein, putative (DUF677) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829582] identity=28.9; qcov=1.17; evalue=1.77e-20; confidence=low
Rice	`Os03g0199100` - identity=27.7; qcov=1.18; evalue=1.75e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05055 (DUF677)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012061

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057795954.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057795954.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057795954.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795954.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795954.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68242383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C64,C66
`Chr1:68242415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr1:68242436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B50,C3,C4
`Chr1:68242499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C4
`Chr1:68242562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr1:68242575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr1:68242589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C4
`Chr1:68242592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,C4,C54,C66
`Chr1:68242598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr1:68242649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,C33,C64,C66
`Chr1:68242666`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B129,B140,B47,B77,C4,C54,C65
`Chr1:68242669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,C33,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795954.1

254 aa

127

254

DUF677

PF05055 DUF677 79-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795954.1`	Pfam	`PF05055`	DUF677	Family	79	212	3.3e-26	92.7	Protein of unknown function (DUF677)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939971.1
ATGACTGCTAAAACTCGCGCCATTGACGTGAACTCGTATGAGCATCAGCTCCAAACCAATCAGCAATTTGTTATGGCGTTTCTTGATCTGCAAAAAAACTCTACCAATAATGAAAAGTTATTGGAGTTTGTCGACAACTTCTACGCTGACACACTCAAGACGCCCGAGTTGTGCGCAGCACTCCAACAACGTCTCATTCACCCTACAAATAACTCTCCATCTGTAACTCATCGCGATTTCTTCCATCATCTATCGTGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012061
ATGACTGCTAAAACTCGCGCCATTGACGTGAACTCGTATGAGCATCAGCTCCAAACCAATCAGCAATTTGTTATGGCGTTTCTTGATCTGCAAAAAAACTCTACCAATAATGAAAAGTTATTGGAGTTTGTCGACAACTTCTACGCTGACACACTCAAGACGCCCGAGTTGTGCGCAGCACTCCAACAACGTCTCATTCACCCTACAAATAACTCTCCATCTGTAACTCATCGCGATTTCTTCCATCATCTATCGTGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795954.1
MTAKTRAIDVNSYEHQLQTNQQFVMAFLDLQKNSTNNEKLLEFVDNFYADTLKTPELCAALQQRLIHPTNNSPSVTHRDFFHHLSCLYKQQLMMRVTLRSFHTCSDQKLHRIDTGKKVSAVFFTAAAAIAATVAAANANTKKPAAAVAAAASILLVALGKWIGSVLRKRERDVKKHMEIIRVMNIGAKISMKDLTKIHVVAQSLQLETESLSGTDGDGEKVMKSLEELRGKANDYCGNMKWARQGVLQSINASS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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