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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001827`

染色体: Chr02 坐标: 33289039-33292499 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001827`
名称	SmilChr02G001827
描述	uncharacterized SmilChr02G001827
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	33289039 - 33292499 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012079`
GeneID	`131012079`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012079`
原始查询	`LOC131012079`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820720]; symbol=AT3G14910; hit=AT3G14910; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820720]; symbol=AT3G14910; hit=AT3G14910; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G14910` (AT3G14910) Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820720] identity=69.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0315800` - identity=57.3; qcov=1.03; evalue=4.59e-176; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0043087 (regulation of GTPase activity)
KEGG	-
Pfam	PF14655 (RAB3GAP2_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012079

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057795971.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057795971.1`
3	Autophagic vesicle	Autophagic vesicle	0.40000	`XP_057795971.1`
4	Autophagosome	Autophagosome	0.40000	`XP_057795971.1`
5	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057795971.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:33289217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C79
`Chr2:33289284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B40
`Chr2:33289361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C79
`Chr2:33289887`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	48	A11,A15,A16,A19,A20,A21,A6,A8,B101,B104,B108,B110,B121,B129,B18,B19,B20,B22,B25,B31,B42,B43,B52,B53,B58,B60,B63,B66,B71,B86,B9,B91,B99,C10,C20,C26,C28,C3,C30,C35,C41,C47,C5,C53,C6,C72,C75,C87
`Chr2:33289929`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B122
`Chr2:33289929`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B122
`Chr2:33289936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:33290200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:33290491`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C26
`Chr2:33290491`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C26
`Chr2:33290498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C5
`Chr2:33290539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795971.1

464 aa

232

464

RAB3GAP2_N

PF14655 RAB3GAP2_N 28-425 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795971.1`	Pfam	`PF14655`	RAB3GAP2_N	Repeat	28	425	5.3e-118	395.6	Rab3 GTPase-activating protein regulatory subunit N-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939988.1
CTGGTATTATTTTTTATTTTTATTTGAGTTGTCCAAAATTCCACACGAAGAAACGACGCGACTCAGAAGTGTCGATCAACCCCGATGCCCTGAATTTCCGGTAATGTCCCGCCGCAATCACACGACAGAGCTCGGATGTATAGCTGGCGCCGATTTGTCGGCTGTCGGCGCGGGGAAGGAAGGATGGCTGGTGGAAAGCCCCAATCTCCTTGTTGCCCTCGACACCAATTCGATCGCGCTCGCCAATCGCTCATTGATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012079
ATGTCCCGCCGCAATCACACGACAGAGCTCGGATGTATAGCTGGCGCCGATTTGTCGGCTGTCGGCGCGGGGAAGGAAGGATGGCTGGTGGAAAGCCCCAATCTCCTTGTTGCCCTCGACACCAATTCGATCGCGCTCGCCAATCGCTCATTGATCCTCATCCTCAATTGGTCTCAATCAATCAACGGCGGCCCCGACACCGACCCAAATCGGGCTGCCAAGATCATACCCGAGCTCTCTCCGATCGAGGCCGAGTACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795971.1
MSRRNHTTELGCIAGADLSAVGAGKEGWLVESPNLLVALDTNSIALANRSLILILNWSQSINGGPDTDPNRAAKIIPELSPIEAEYISAVEWLVFDDDIRVLTVGTSCGYLMIFSIQGRLIHRQIVNPGKILKIRVRGIKQDLTQDTSSEEVCVVMPGVVARFDGSDIKSLLQQWFQESHSQLWDQDFNTFQDNSGNRVRSLPYQLWNVSKYGVCADAAITGVMPPPLMEIQSSQRYYCAVTIGNDAVISAFRLSVDKSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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