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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005034`

染色体: Chr01 坐标: 68288708-68289499 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005034`
名称	SmilChr01G005034
描述	UPF0496 protein At4g34320-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68288708 - 68289499 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012087`
GeneID	`131012087`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012087`
原始查询	`LOC131012087`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0496 protein At4g34320-like
产物	UPF0496 protein At4g34320-like
Arabidopsis	`AT4G34320` (AT4G34320) transmembrane protein, putative (DUF677) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829582] identity=30.6; qcov=0.882; evalue=5.78e-25; confidence=low
Rice	`Os03g0199100` - identity=26.8; qcov=1.14; evalue=6.15e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05055 (DUF677)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012087

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057795988.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057795988.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795988.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795988.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795988.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68289013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B35,B37,B49,B74
`Chr1:68289119`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	58	A1,A13,A14,A18,A23,A24,A3,A9,B1,B108,B11,B112,B118,B123,B126,B131,B132,B135,B14,B20,B23,B25,B40,B41,B45,B5,B51,B52,B58,B6,B60,B62,B69,B7,B71,B78,B79,B8,B97,C1,C16,C18,C25,C33,C41,C45,C46,C48,C58,C59,C62,C7,C72,C75,C8,C83,D1,D6
`Chr1:68289185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:68289230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B22
`Chr1:68289239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C4,C65
`Chr1:68289257`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B82,C28,C50,C74
`Chr1:68289257`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B82,C28,C50,C74
`Chr1:68289261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr1:68289334`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D4
`Chr1:68289334`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D4
`Chr1:68289404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B22
`Chr1:68289433`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A15,B130,B134,B139,B29,B49,B74,B9,C28,C37,C64,C85,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795988.1

263 aa

132

263

DUF677

PF05055 DUF677 86-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795988.1`	Pfam	`PF05055`	DUF677	Family	86	230	6.2e-31	108.3	Protein of unknown function (DUF677)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940005.1
ATGAACACGAGCGCTGCTAAAAGTTGCGCCGCCTCTTACGCCATTGAGGTAAATTCGTATGAGCAGCAGCTCCAAACCAATCAAAAATTTGTTATGGCGTTTCAGGATCTGCCAAAAAACCTTACCAATAATGAAAAATTATTGGAGTTTTTCGGCAACTACTATGCCGACACACTCAAAACGCCGGAGTTCTGCGCAACACTCCGACAACGTCTCAACCCTACAAATAACTCTCCATCGAGTTTGGAAGTAAGTGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012087
ATGAACACGAGCGCTGCTAAAAGTTGCGCCGCCTCTTACGCCATTGAGGTAAATTCGTATGAGCAGCAGCTCCAAACCAATCAAAAATTTGTTATGGCGTTTCAGGATCTGCCAAAAAACCTTACCAATAATGAAAAATTATTGGAGTTTTTCGGCAACTACTATGCCGACACACTCAAAACGCCGGAGTTCTGCGCAACACTCCGACAACGTCTCAACCCTACAAATAACTCTCCATCGAGTTTGGAAGTAAGTGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795988.1
MNTSAAKSCAASYAIEVNSYEQQLQTNQKFVMAFQDLPKNLTNNEKLLEFFGNYYADTLKTPEFCATLRQRLNPTNNSPSSLEVSDDDFFHDLSCFYRQQLMMRVTLRSLDDSFNEKLDRINTWKKVSAVLFTAAAAIAATVAAVNANTNKPAAATAAAVSILLVALGKWINSLMRKRESGVKKQKQIIGVMIIGARITMKDLSNIYVLSRRLQFEIDSMSETVANINKRIQNLRDKAVDYSGNLNWTRQLVLQSISALN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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