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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002064`

染色体: Chr02 坐标: 37199198-37201850 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002064`
名称	SmilChr02G002064
描述	uncharacterized SmilChr02G002064
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	37199198 - 37201850 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012261`
GeneID	`131012261`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012261`
原始查询	`LOC131012261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription elongation factor B polypeptide [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818878]; symbol=AT2G42780; hit=AT2G42780; species=arabidopsis; confidence=high
产物	transcription elongation factor B polypeptide [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818878]; symbol=AT2G42780; hit=AT2G42780; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G42780` (AT2G42780) transcription elongation factor B polypeptide [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818878] identity=47.3; qcov=0.957; evalue=1.06e-63; confidence=high
Rice	`Os08g0169600` - identity=45; qcov=0.431; evalue=1.02e-25; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006368 (transcription elongation by RNA polymerase II); GO:0070449 (elongin complex)
KEGG	-
Pfam	PF06881 (Elongin_A)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012261

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796152.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057796152.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796152.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796152.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796152.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:37200500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:37200676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B101,B126
`Chr2:37200750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B84,C26,C77,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796152.1

232 aa

116

232

Elongin_A

PF06881 Elongin_A 24-132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796152.1`	Pfam	`PF06881`	Elongin_A	Family	24	132	6e-23	82.1	RNA polymerase II transcription factor SIII (Elongin) subunit A

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940169.1
TGCGGCCTAATATAAAGGTGATTCCTGAAAAATAAAAAGGAAAAAGTGAAAAACACTAATATGAGGCGCACATAATTGTAATTGCAATCGTAATAATCTGTTATCGCTGACGTCATCATCTCCTCCGTCTCCAGCTCCGATCCCATCAAAGGTGAAAGAAGTGTTGCAGAATGATGCAAAAAGCACCATCATTGGTCGACTTATGTGTTCATTTGGCAATAGACAATGTTAGGTATCTAGGAGATGTTGGAGAAACAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012261
ATGATGCAAAAAGCACCATCATTGGTCGACTTATGTGTTCATTTGGCAATAGACAATGTTAGGTATCTAGGAGATGTTGGAGAAACAGACCACCATCTCTTAGAACGCATTTTATGCCACTGTACACTTGATCAGTTGATGCACATTGAGAATAGCACAGCAGATAGAGATCTTAGCCCTGTCACCGATAAATTATGGAAGAGATTTTTCAAGGATAGTTTTGGTGAGGATAGCTTCAATATAGTCGTTGAGAAGATGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796152.1
MMQKAPSLVDLCVHLAIDNVRYLGDVGETDHHLLERILCHCTLDQLMHIENSTADRDLSPVTDKLWKRFFKDSFGEDSFNIVVEKMRQKKVTFKWKQLYEAKLKEREEATQKSLDRIKQRYLEEDAKKRTRQVQLCSKVPPSSKKRNFWGGETASNIYNTKSSIMKKSKIDFINSREVKNLAAMKSIATMKSKVLHKNHSVLSKPKLINTSGSASSSSSSSNKMIKPFRRRF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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