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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002065`

染色体: Chr02 坐标: 37203806-37207969 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002065`
名称	SmilChr02G002065
描述	glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A, chloroplastic/mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	37203806 - 37207969 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012262`
GeneID	`131012262`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012262`
原始查询	`LOC131012262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A, chloroplastic/mitochondrial
产物	glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A%2C chloroplastic/mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G25660` (AT3G25660) Amidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822154] identity=72.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0643200` (GATA) - identity=71.8; qcov=0.832; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006412 (translation); GO:0030956 (glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase complex); GO:0050567 (glutaminyl-tRNA synthase (glutamine-hydrolyzing) activity)
KEGG	smil00970 (Aminoacyl-tRNA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01425 (Amidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012262

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057796153.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057796153.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796153.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796153.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796153.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:37205509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:37205869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,C10,C16,C71
`Chr2:37206528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,D11
`Chr2:37206651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A19,B68,C43
`Chr2:37207392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:37207595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:37207754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,B98
`Chr2:37207801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:37207822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:37207856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796153.1

541 aa

270

541

Amidase

PF01425 Amidase 64-515 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796153.1`	Pfam	`PF01425`	Amidase	Domain	64	515	2.5e-144	482.4	Amidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940170.1
GGTTCATGAACCTCTGCTAAGCCCCTCAATTATCCACTGCGCTCCGTCAAAAAATGCTATCTTCAGCCCAAACCCCTCGCCTCCTCCGCTCCCCCGCCGCCGCCACCATCACCGCCGCTTCCCTCACCTTCAAATGCCTCCACACCTCCCCCATCCTCACCCCCGCCTCCACTTCGCCGTCTCCCTCCCAAATCCTCACGAACCGCAAAGCCCTACTCTCGCGCCAGACCTCCGCCGTCGACCTCGCCAAGTCGTTTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012262
ATGCTATCTTCAGCCCAAACCCCTCGCCTCCTCCGCTCCCCCGCCGCCGCCACCATCACCGCCGCTTCCCTCACCTTCAAATGCCTCCACACCTCCCCCATCCTCACCCCCGCCTCCACTTCGCCGTCTCCCTCCCAAATCCTCACGAACCGCAAAGCCCTACTCTCGCGCCAGACCTCCGCCGTCGACCTCGCCAAGTCGTTTCTGCAGCGCCTCCGCCGCCACGAACCCGAACTAAGCAGCTTCCTCTACGTCTCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796153.1
MLSSAQTPRLLRSPAAATITAASLTFKCLHTSPILTPASTSPSPSQILTNRKALLSRQTSAVDLAKSFLQRLRRHEPELSSFLYVSPEDIVLKQAEELDNKIKNNEEVGPLAGVFVGVKDNICTYDMPSTAGSRILENYRPPFDATAVRKLRERGAIVIGKTNLDEFGMGSTTEGSAYQVTANPWDLSRVPGGSSGGSAAAVSARQCMVALGSDTGGSVRQPASFCGVVGLKPTYGRVSRYGLVAYASSLDVIGCFGSSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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