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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002140`

染色体: Chr02 坐标: 38536958-38539443 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002140`
名称	SmilChr02G002140
描述	uncharacterized SmilChr02G002140
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	38536958 - 38539443 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012312`
GeneID	`131012312`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012312`
原始查询	`LOC131012312`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0946800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0946800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0946800` - identity=25; qcov=0.523; evalue=6.05e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012312

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796236.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796236.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796236.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796236.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796236.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:38537277`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A1
`Chr2:38537277`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A1
`Chr2:38537283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C77
`Chr2:38537305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C77
`Chr2:38537314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr2:38537494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B21,B64,C26,C71
`Chr2:38537515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B29,B81,C87
`Chr2:38537694`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B73,C31
`Chr2:38537694`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B73,C31
`Chr2:38537821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr2:38537838`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B130,B139,B42,B73,C27,C28,C75
`Chr2:38537864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796236.1

428 aa

214

428

DUF8566

PF29561 DUF8566 169-371 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796236.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	169	371	4.3e-53	180.8	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940253.1
CAAGAAATCATTGAAGTCATGTGTTTTTTTTTACTTATATTATTTTCAATGGTTTGAAAGTGAAATATTTGTTTTTTTTTTTTTTGTGTATTTGCACGTGTTAGACATTGAACTATGCTAATTATATTTTTATTTCATGTTTTGAGTTAAGGTACTAAGAATGGCTGCTCAATCCAAAAAGAAAAAGAATCAGAAAGGTTATGCTGAGGGAACAGGTGATTCCCCTGTCAAAAAGAAGCAAAAGAGAATTTCACTTCCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012312
ATGGCTGCTCAATCCAAAAAGAAAAAGAATCAGAAAGGTTATGCTGAGGGAACAGGTGATTCCCCTGTCAAAAAGAAGCAAAAGAGAATTTCACTTCCTGGTATAGTTATTCGAGAACCGATTTCTGGCCAAGTGAAGGGACCATGTACAATTCAACAAGATAAAAATAAGGGAAAAGGAAAAATAATTTTAGATCCCGACTCTGCCAAAGTAAAGAAATCGCGTACAGTGCAACAATATAAAAACAAGAATCCAGATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796236.1
MAAQSKKKKNQKGYAEGTGDSPVKKKQKRISLPGIVIREPISGQVKGPCTIQQDKNKGKGKIILDPDSAKVKKSRTVQQYKNKNPDQMIEGECSKAAERKKNKGKRMLSEEDKNEESESSDDDDFEVVHPRVQIANLMDVRCKRRGVKENFPKKKKVRQIMASVPGLRTRTSPASLFKKISLMNEAQKQAVRDMGFGSVLQLGVRKLPGKLAFWVVEHFDCKSCSIVVGGNQGIRVDEDDVYRVYGFPKDKKEIEIFERK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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