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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002156`

染色体: Chr02 坐标: 38778878-38780918 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002156`
名称	SmilChr02G002156
描述	flavonoid 8-O-methyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	38778878 - 38780918 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012348`
GeneID	`131012348`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012348`
原始查询	`LOC131012348`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	flavonoid 8-O-methyltransferase 1-like
产物	flavonoid 8-O-methyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT4G35150` (AT4G35150) O-methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829667] identity=34.1; qcov=1.01; evalue=2.84e-56; confidence=low
Rice	`Os08g0290700` - identity=41.5; qcov=1.01; evalue=1.3e-95; confidence=medium
GO	GO:0008171 (O-methyltransferase activity); GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0019438 (GO:0019438); GO:0032259 (methylation); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00891 (Methyltransf_2); PF08100 (Dimerisation)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012348

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057796260.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057796260.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796260.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796260.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796260.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:38779096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B94,C38,C45,C49
`Chr2:38779295`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A2,A3,B109,B120,B13,B130,B135,B139,B20,B29,B33,B4,B46,B49,B84,B97,C11,C20,C22,C26,C42,C60,C69,C7,C71,C72,C77
`Chr2:38780011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B64,C17,C43
`Chr2:38780165`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B63,B83
`Chr2:38780165`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr2:38780198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B31,B50,C86
`Chr2:38780207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,B82,B95
`Chr2:38780280`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B40
`Chr2:38780280`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B40
`Chr2:38780373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr2:38780512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr2:38780534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796260.1

357 aa

178

357

Dimerisation

Methyltransf_2

PF08100 Dimerisation 21-107 aa PF00891 Methyltransf_2 129-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796260.1`	Pfam	`PF08100`	Dimerisation	Domain	21	107	3.3e-21	75.7	O-methyltransferase dimerisation domain
`XP_057796260.1`	Pfam	`PF00891`	Methyltransf_2	Domain	129	339	4.7e-55	186.9	O-methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940277.1
ATCTAAATTAAATAAATATTTAATAAGAATAATAATATTAACTCTGTCAGGTTACACGAATCCGACGTGGCCACGATAAGGACACTAAGCCGATCGATAAGGCCAACCATAATTGACCATTACAAAATTAAAACTAGTACTTTATAGCATGCCTATAAATGAACAAAACTCTCACATATATTCTAATTCAAGTACACTAGAACTCCAACAATGGCGTTGGCCAATGCAGTAGATTCCACCCAAGAATTTCTGGATGCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012348
ATGGCGTTGGCCAATGCAGTAGATTCCACCCAAGAATTTCTGGATGCTCAAACCCATGTTTGGAATCTCACTTTCAACTTCATAAATTCCATGTCCCTAAAATCCGCTCTTCAATTAGGCATACCCGATATCATTCGCAAACACGGCAAGCCTATCACACTTTCTCAACTAGCCGATGCCCTTCCTATCAACAAAGCCAAATCCCACGGCCTCCACCGCTTGATGCGGATTCTAGTCCACTCCAAGATCTTCGACCTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796260.1
MALANAVDSTQEFLDAQTHVWNLTFNFINSMSLKSALQLGIPDIIRKHGKPITLSQLADALPINKAKSHGLHRLMRILVHSKIFDLVKNDEGEDAYSLTVASRLLLRDEPFGFAHFALSMIDPVVVDSFHHVTEWFGDECPTPFFTRNGTTVWEYAGNDKNWNKLFNEGMASDARFTGNFLVENCKHVFEGLNTVVDVAGGTGAVAKAAAAAFPGLKCTVLDLPHVVAGLEGSQNLSFVSGNMFEFIPPADAVILKWILH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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