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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002185`

染色体: Chr02 坐标: 39059722-39063091 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002185`
名称	SmilChr02G002185
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39059722 - 39063091 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012373`
GeneID	`131012373`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012373`
原始查询	`LOC131012373`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290
Arabidopsis	`AT1G11330` (AT1G11330) S-locus lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837675] identity=41.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os01g0783800` - identity=42.3; qcov=1.02; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0048544 (recognition of pollen)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00954 (S_locus_glycop); PF01453 (B_lectin); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08276 (PAN_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012373

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796285.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796285.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796285.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796285.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796285.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39059931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B114,B115,B126,B70
`Chr2:39059945`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B127,D10
`Chr2:39059945`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B127,D10
`Chr2:39060058`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	48	A2,A25,B100,B109,B111,B114,B115,B121,B126,B129,B130,B2,B25,B33,B36,B37,B49,B51,B53,B54,B58,B6,B8,B81,B82,B85,B88,B92,B98,C11,C13,C16,C19,C22,C26,C29,C36,C37,C42,C59,C61,C65,C71,C74,C81,D4,D6,D9
`Chr2:39060062`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	47	A2,A25,B100,B109,B111,B115,B121,B126,B129,B130,B2,B25,B33,B37,B49,B51,B53,B54,B58,B6,B75,B8,B81,B82,B85,B88,B92,B98,C11,C13,C16,C19,C20,C22,C26,C29,C36,C37,C59,C61,C65,C71,C74,C81,D4,D6,D9
`Chr2:39060063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:39060078`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	60	A2,A25,B100,B109,B111,B114,B12,B121,B126,B128,B129,B130,B17,B25,B29,B33,B36,B37,B39,B49,B51,B53,B54,B56,B58,B6,B63,B65,B7,B74,B75,B8,B80,B81,B82,B85,B88,B98,C11,C13,C15,C16,C19,C20,C22,C26,C29,C30,C34,C37,C59,C61,C65,C7,C71,C74,C86,D4,D6,D9
`Chr2:39060080`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	60	A2,A25,B100,B109,B111,B114,B12,B121,B126,B128,B129,B130,B17,B25,B29,B33,B36,B37,B39,B49,B51,B53,B54,B56,B58,B6,B63,B65,B7,B74,B75,B8,B80,B81,B82,B85,B88,B98,C11,C13,C15,C16,C20,C22,C26,C29,C30,C34,C37,C59,C61,C65,C69,C7,C71,C74,C86,D4,D6,D9
`Chr2:39060272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B64,C17,C43
`Chr2:39060275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr2:39060472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:39060603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B107,B20,B37,B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796285.1

820 aa

410

820

B_lectin

S_locus_glycop

PAN_2

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF01453 B_lectin 74-173 aa PF00954 S_locus_glycop 206-311 aa PF08276 PAN_2 334-394 aa PF00069 Pkinase 506-705 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 508-773 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796285.1`	Pfam	`PF01453`	B_lectin	Repeat	74	173	5e-20	72.6	D-mannose binding lectin
`XP_057796285.1`	Pfam	`PF00954`	S_locus_glycop	Domain	206	311	1e-22	81.5	S-locus glycoprotein domain
`XP_057796285.1`	Pfam	`PF08276`	PAN_2	Domain	334	394	3.6e-12	46.9	PAN-like domain
`XP_057796285.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	506	705	1.2e-43	150.2	Protein kinase domain
`XP_057796285.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	508	773	2.6e-48	165.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940302.1
TATAATAACCAGGATATATATGATTTGAATATCATGTTTTCATATTCATGTTCTTAATTGTGTAATGGGTGTGAATTTTTTTATTTATTTTTGTTTAAAAGTCACATTTGGTGGCTGTGACGGGTACTAATGAGCTTGGAAAATGAAGTGATGGCTGCTATAGAAGGTTCTGCGAATAACAATGGTGTAACGACTTTATTCTAGTCAGAAACGAAGACTTTTAAAGTTCCAGACTTGGTCTCTCAAATGATATCAGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012373
ATGCGTTTCTCGTTATCTTGTTTCTTCTTGGTGTTGTGCATCTCCAACTTTATCTCAGTTTGTAATGGATCAGATGGCATATCAGCAGGTGAATCTCTGTTTCCAAACCAGACGATAATCTCTAAAGAGGGCAAGTTTGAACTTGGATTCTTCACTCCGGGTAACTCTAGCAGTAGCAGCTATTATGTTGGAATATGGTATAAAAACATACCAGTTGAAACAGTGGTGTGGGTTTTGAATCGAAATTACTCCATCCAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796285.1
MRFSLSCFFLVLCISNFISVCNGSDGISAGESLFPNQTIISKEGKFELGFFTPGNSSSSSYYVGIWYKNIPVETVVWVLNRNYSIQSSFLDTCLLQMSNSSLNLIVNSKVIWRSAASLYVTEALILDTGNFVLRNSSGILWQSFSNPTDTWLPGAMVGFNRSSNDEAKLVSWRNNDDPASGHVSLGMEPNGGAEIFMKKNGIETLWRSGIWEGGTFPSFTSLSPWYNFSFVSREDGAFFTYNAMNESWVVRIVFNYEGVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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