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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002193`

染色体: Chr02 坐标: 39152112-39153710 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002193`
名称	SmilChr02G002193
描述	uncharacterized SmilChr02G002193
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39152112 - 39153710 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012380`
GeneID	`131012380`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012380`
原始查询	`LOC131012380`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G60410; symbol=AT3G60410; hit=AT3G60410; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G60410; symbol=AT3G60410; hit=AT3G60410; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G60410` (AT3G60410) - identity=40.6; qcov=0.676; evalue=4.8e-20; confidence=low
Rice	`Os01g0689000` - identity=39.2; qcov=0.659; evalue=2.1e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07797 (DUF1639)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012380

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796290.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796290.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796290.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796290.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796290.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39152651`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	37	A1,A11,A13,A19,A21,A4,A6,B106,B107,B117,B122,B137,B140,B19,B20,B59,B62,B66,B67,B68,B7,B73,B76,B80,B99,C27,C31,C50,C52,C61,C74,C76,C79,C8,C83,D11,D7
`Chr2:39152678`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B108,B111,B62
`Chr2:39152678`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B108,B111,B62
`Chr2:39152684`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B108,B111,B62
`Chr2:39152684`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B108,B111,B62
`Chr2:39152698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B111
`Chr2:39152794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B120
`Chr2:39152804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B120
`Chr2:39153212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:39153234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C5
`Chr2:39153244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:39153248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796290.1

221 aa

110

221

DUF1639

PF07797 DUF1639 128-177 aa

XP_057796291.1

182 aa

182

DUF1639

PF07797 DUF1639 128-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796290.1`	Pfam	`PF07797`	DUF1639	Family	128	177	2.2e-24	85.9	Protein of unknown function (DUF1639)
`XP_057796291.1`	Pfam	`PF07797`	DUF1639	Family	128	177	2.3e-24	85.8	Protein of unknown function (DUF1639)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940307.1
ACATTGATAAACTAGGAATATGTATATGGGCATCCAATTGGTTTTCCCAAAGTAAGCTTAACGCCATGAGTATTCTGTCTTTGGGTGTCATCCAAACACACCCTACAGAAACCAACACCTAAGCTTGGGTTCCTTCATGTTGTGTTGAACACAACAACATACTACTGCTTCTGCGCCTCTTTCTCTCTCTAAAATTCTTTTTTAGCTTCAACTCCTCTGTTTCATTGCCCGTTCTCTGCTTCCCTCCGCCGCAAATCCGC...

XM_057940308.1
TTGATAAACTAGGAATATGTATATGGGCATCCAATTGGTTTTCCCAAAGTAAGCTTAACGCCATGAGTATTCTGTCTTTGGGTGTCATCCAAACACACCCTACAGAAACCAACACCTAAGCTTGGGTTCCTTCATGTTGTGTTGAACACAACAACATACTACTGCTTCTGCGCCTCTTTCTCTCTCTAAAATTCTTTTTTAGCTTCAACTCCTCTGTTTCATTGCCCGTTCTCTGCTTCCCTCCGCCGCAAATCCGCCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012380
ATGATGGCGGCACCACCGGTGAAATCGCAACCATTGCACAACTTCTCCCTGCCCCACCTCAAATGGGCCCACAAGAACTCCTCCCCCTCCGCCCCCCACAACCACCGCTTCCGCCGCCGCGATCACCACCGCCGCACCGACCCCGACCCCGACCCCGACAACCCCAAGCCGCCAGCCGACGACCCGGCCGTCGACGAGGAGAATGGGGAAGGCAAGCCGTGGAAGCTGCGGCCGCGGAAGGAGCCCATCAAGGCGCCGTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796290.1
MMAAPPVKSQPLHNFSLPHLKWAHKNSSPSAPHNHRFRRRDHHRRTDPDPDPDNPKPPADDPAVDEENGEGKPWKLRPRKEPIKAPSASKKETNNDGVKSQRLRGMAEGAQQSGSVERTAKRKVWISLSREEIEEDVYALTGGKPARRPKKWPKNVQKQLDGVFPGLYLVGVAADSYRVMMSWYGLLFDFFIYLNFFCMQCMCYNSSNYSVKEKIIVGEVY

XP_057796291.1
MMAAPPVKSQPLHNFSLPHLKWAHKNSSPSAPHNHRFRRRDHHRRTDPDPDPDNPKPPADDPAVDEENGEGKPWKLRPRKEPIKAPSASKKETNNDGVKSQRLRGMAEGAQQSGSVERTAKRKVWISLSREEIEEDVYALTGGKPARRPKKWPKNVQKQLDGVFPGLYLVGVAADSYRVMMS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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