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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002204`

染色体: Chr02 坐标: 39257977-39259892 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002204`
名称	SmilChr02G002204
描述	protein PAL OF QUIRKY
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39257977 - 39259892 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012383`
GeneID	`131012383`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012383`
原始查询	`LOC131012383`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PAL OF QUIRKY
产物	protein PAL OF QUIRKY
Arabidopsis	`AT4G05150` (AT4G05150) Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825863] identity=46.7; qcov=1.09; evalue=3.14e-92; confidence=high
Rice	`Os07g0556300` - identity=50.8; qcov=0.445; evalue=2.57e-47; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00564 (PB1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012383

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796296.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057796296.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796296.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796296.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796296.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39258298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr2:39258497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,D9
`Chr2:39258502`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B103
`Chr2:39258502`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B103
`Chr2:39259350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr2:39259360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:39259361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B81,C36,C85
`Chr2:39259535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796296.1

411 aa

206

411

PB1

PF00564 PB1 44-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796296.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	44	130	5.3e-18	65.5	PB1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940313.1
ATTTATTTGAGAAGCAGATTGTTAAAAACTTGAAATATGAGATCTATTCCATAATTACATTTTTGCAATTATATGAATATATTTTGTCTTTAACGAAAAAGAATGGATAGTTCTCAGATTTAAGGGGAAGTTAAAAATCTGAATCTGTGGGGTGCAGCCGTGCAGGGGTGGGTGAGTCCTGACGGAGTAGTCTACTCTTGTGTGTGAAAGACAAAAAAATGGTGGGTTTAATAAGATGACACCCACCTCCGCTTTAGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012383
ATGGCCGATCTCGATTCTAACCCCGCCGATTCCCTCGCCTCCACCCCGCGCTCCGACCTCCACGATGACGCCCTTCAGCCGCGCGTCCGCTTCATGTGCAGCTTCGGCGGCAAAATCCTCCCCCGCCCCCACGACAACCAGCTCCGCTACTTCGGCGGCGATACCCGCATCGTCGCCGTCCACCGCCACACCACCTTCGCCGCTCTCCTCTCCAAGCTCTCCAAGTTTTCAGGTACAACCAACATAAGCATAAAGTACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796296.1
MADLDSNPADSLASTPRSDLHDDALQPRVRFMCSFGGKILPRPHDNQLRYFGGDTRIVAVHRHTTFAALLSKLSKFSGTTNISIKYQLPNEDLDALITVTADEDVENMMEEYDRLSQSQKSARLRLFLFPIDDSINDSRASSINSLLDGSAKRENWFVDVLNGGPAAGSVLERGRSEVSSIVSEVPDYLFGLDNSDDALKDTTKIRNKNLLNDNVSMSDPGSPAPVVSSPFCSTSSSLAPPNLQMIPDLPPVKTRPINPV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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