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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002205`

染色体: Chr02 坐标: 39292843-39296777 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002205`
名称	SmilChr02G002205
描述	guanine nucleotide-binding protein-like NSN1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39292843 - 39296777 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012384`
GeneID	`131012384`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012384`
原始查询	`LOC131012384`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	guanine nucleotide-binding protein-like NSN1
产物	guanine nucleotide-binding protein-like NSN1
Arabidopsis	`AT3G07050` (NSN1) GTP-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819890] identity=72.1; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0375000` (Os_F0781) - identity=64.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005525 (GTP binding); GO:0005730 (nucleolus)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01926 (MMR_HSR1); PF02421 (FeoB_N); PF08701 (GN3L_Grn1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012384

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796297.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057796297.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.20000	`XP_057796297.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796297.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796297.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39293585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:39293639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B20,B62
`Chr2:39293640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B15,B56,B64,B96
`Chr2:39293675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr2:39295153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr2:39295303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:39295683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr2:39296299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B81,C36,C85
`Chr2:39296315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B81,C36,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796297.1

582 aa

291

582

GN3L_Grn1

MMR_HSR1

FeoB_N

PF08701 GN3L_Grn1 15-91 aa PF01926 MMR_HSR1 257-324 aa PF02421 FeoB_N 257-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796297.1`	Pfam	`PF08701`	GN3L_Grn1	Family	15	91	1.8e-18	67.1	GNL3L/Grn1 putative GTPase
`XP_057796297.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	257	324	1.5e-17	64.4	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057796297.1`	Pfam	`PF02421`	FeoB_N	Domain	257	324	1.8e-11	44.5	Ferrous iron transport protein B

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940314.1
TTAAACGTTTTTAAAAACAATTTTGAATATTTTGAAGTCGATTTTGGTAACCCTAGAAGTCGAAACTGGTATCCCGCCTTTTATTCTGCCGATTGCCTGACCGTCGACTTCAAGCCCCTCTCTTCCGCCTAGTCGTCAGTCGGAACGCCAACATGGTGAAGAAGAGCAAAAAGAGCAAGAGCAAGAGGGTGCCGCTGAGGAAGAAGTACAAGATTATACGGAAGGTGAAGGAGCACCAGAAGAAGAAAGCCAAAGAGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012384
ATGGTGAAGAAGAGCAAAAAGAGCAAGAGCAAGAGGGTGCCGCTGAGGAAGAAGTACAAGATTATACGGAAGGTGAAGGAGCACCAGAAGAAGAAAGCCAAAGAGGCCAAGAAATTAGGGATCGACAAAAAGCCCAAAGTCGAAAAGGATCCCGGCATCCCCAACGATTGGCCTTTCAAGGAGCAGGAGCTCAAAGCCCTTGAGGTCCGCCGCCAACGCGCAATTGAGGAGCTCGAGGCAAAGAAAGCCGCTCGAAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796297.1
MVKKSKKSKSKRVPLRKKYKIIRKVKEHQKKKAKEAKKLGIDKKPKVEKDPGIPNDWPFKEQELKALEVRRQRAIEELEAKKAARKERAQKRKLGLLDDEEIKGGEEGINENPTNVTRKVDNSEKAFYKELVKVIEASDVILEVLDARDPLGTRCVDMEKMVLSAGPDKRLVLLLNKIDLVPREAAEKWLKYLREELPAVAFKCSTQEQKSNLGWKSAPKAGKTKNLLQTSDCLGAETLINLLKNYSRSHDIKKSITVGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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