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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr01G005274

染色体: Chr01 坐标: 70175541-70176286 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr01G005274
名称SmilChr01G005274
描述sterol 14-demethylase-like
染色体 / SeqIDChr01 / NC_080387.1
坐标与链方向70175541 - 70176286 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131012386
GeneID131012386
locus_tag-
NCBI NameLOC131012386
原始查询LOC131012386

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述sterol 14-demethylase-like
产物sterol 14-demethylase-like
ArabidopsisAT1G11680 (CYP51G1)
CYTOCHROME P450 51G1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837712]
identity=78.8; qcov=0.984; evalue=8.47e-111; confidence=high
RiceOs11g0525200 (OsCYP51G1)
-
identity=74.2; qcov=0.973; evalue=3.52e-104; confidence=high
GOGO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG-
PfamPF00067 (p450)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131012386

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Endoplasmic reticulum 内质网 0.60000 XP_057796304.1
2 Mitochondrion 线粒体 0.40000 XP_057796304.1
3 Mitochondrion membrane 线粒体膜 0.20000 XP_057796304.1
4 Peroxisome 过氧化物酶体 0.20000 XP_057796304.1
5 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057796304.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796304.1
187 aa
N
1
94
187
p450
C
PF00067 p450 1-156 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057796304.1 Pfam PF00067 p450 Domain 1 156 1.5e-36 126.9 Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057940321.1
CTTCTCTGCAACCCCAAATACATGTCAACCGTGCTGGAGGAGCAGAAGACGATCGTGCAGAAACATGGAAACGAGGTTCATTACGACGTGCTAGCTGAGATGGAAGTTCTTTACAGATGCATAAAAGAAGCTCTGAGGCTCCACCCTCCGTTGATAATGCTTCTCCGGAGCTCACACAGCGACTTCACGGTGAAGACCAAGGAAGGGGCGGAATACGACATCCCCAAGGGACACATTGTGGCCACATCGCCTGCCTTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131012386
CTTCTCTGCAACCCCAAATACATGTCAACCGTGCTGGAGGAGCAGAAGACGATCGTGCAGAAACATGGAAACGAGGTTCATTACGACGTGCTAGCTGAGATGGAAGTTCTTTACAGATGCATAAAAGAAGCTCTGAGGCTCCACCCTCCGTTGATAATGCTTCTCCGGAGCTCACACAGCGACTTCACGGTGAAGACCAAGGAAGGGGCGGAATACGACATCCCCAAGGGACACATTGTGGCCACATCGCCTGCCTTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057796304.1
LLCNPKYMSTVLEEQKTIVQKHGNEVHYDVLAEMEVLYRCIKEALRLHPPLIMLLRSSHSDFTVKTKEGAEYDIPKGHIVATSPAFANRLPHIYKDPETYDPDRFAPGRDEDKAAGAFSYIAFGGGRHGCLGEPFAYLQIKTIWSHLLRNFEMELVSPFPEIDWNAMVVGVKGKVMVRYKRRALPLN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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