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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002219`

染色体: Chr02 坐标: 39459893-39466174 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002219`
名称	SmilChr02G002219
描述	uncharacterized SmilChr02G002219
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39459893 - 39466174 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012397`
GeneID	`131012397`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012397`
原始查询	`LOC131012397`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquinol-cytochrome C chaperone family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835197]; symbol=AT5G51220; hit=AT5G51220; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ubiquinol-cytochrome C chaperone family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835197]; symbol=AT5G51220; hit=AT5G51220; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G51220` (AT5G51220) ubiquinol-cytochrome C chaperone family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835197] identity=61.1; qcov=1; evalue=6.97e-119; confidence=high
Rice	`Os07g0490300` - identity=67.7; qcov=0.796; evalue=1.66e-110; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0034551 (mitochondrial respiratory chain complex III assembly)
KEGG	-
Pfam	PF03981 (Ubiq_cyt_C_chap)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012397

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057796334.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057796334.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057796334.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796334.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796334.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39460730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:39460800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B71,C42
`Chr2:39462024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B9,C30,C40
`Chr2:39462108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:39462550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr2:39462559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:39464982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796334.1

280 aa

140

280

Ubiq_cyt_C_chap

PF03981 Ubiq_cyt_C_chap 129-270 aa

XP_057796335.1

280 aa

140

280

Ubiq_cyt_C_chap

PF03981 Ubiq_cyt_C_chap 129-270 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796334.1`	Pfam	`PF03981`	Ubiq_cyt_C_chap	Family	129	270	7.4e-37	127.3	Ubiquinol-cytochrome C chaperone
`XP_057796335.1`	Pfam	`PF03981`	Ubiq_cyt_C_chap	Family	129	270	7.4e-37	127.3	Ubiquinol-cytochrome C chaperone

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940351.1
ATGAGCCCAAACCCTTCCTATCTTCTTCTCCGCACAGCACAAACTGCTCACTGCTTTCTCTCTCTCGGACTCTCGTTCAGCAATCGTCACAGCAGCTGCCGCGCACACCATCATCTCCCTAGCCTCTCGCCCTCTGTCTTACTTCATCTATCTCCTTGCTACAGAGCACCCACACACCAAACAGAAACCCTCCTTCACGAATTCCGGCGAGATCCGCCATTTAATGTGGTGCTCTGTTGTTGCAACAGCACGGCGCCGCC...

XM_057940352.1
ACCCTTCCTATCTTCTTCTCCGCACAGCACAAACTGCTCACTGCTTTCTCTCTCTCGGACTCTCGTTCAGCAATCGTCACAGCAGCTGCCGCGCACACCATCATCTCCCTAGCCTCTCGCCCTCTGTCTTACTTCATCTATCTCCTTGCTACAGAGCACCCACACACCAAACAGAAACCCTCCTTCACGAATTCCGGCGAGATCCGCCATTTAATGTGGTGCTCTGTTGTTGCAACAGCACGGCGCCGCCGCCGACTCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012397
ATGTTGCCGAGGTGGGGCAGAGTTTTGAGCCGTATAAACAGGATTAACAGTATTCAGAAGAGCAGTGAATTAGTGAAGAAAGAATCATCACTTTTTCTGTTCCGGGATTATGCAAAAGTTGCTGCCGCTGTGGAGCCAAATGCTAAGAGCGACATTATCAAACCGGAGGTGAATCTTAACAAGTTGTTTTGGTCGAAGCCACGTTCATTGGCATTGGCAGCTGACTCACCATATAGAATTAATGATCCCCAATACAAGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796334.1
MLPRWGRVLSRINRINSIQKSSELVKKESSLFLFRDYAKVAAAVEPNAKSDIIKPEVNLNKLFWSKPRSLALAADSPYRINDPQYKGIRRFILKLMLFYSKQSQFIRWANAIYVRVRYQVDRRAIYDVFSLEQTFKTTFSLLVLHMWLCLRRLKEEGKDGVELGQYLFEIYNHDLELRVSKAGVNLLLSKWMKELEKIFYGNIVAYDAAIGKHDDLQNVIWRNVYSDDGTSKPSKGALVSVQAFTRYVRREASSLSLTDK...

XP_057796335.1
MLPRWGRVLSRINRINSIQKSSELVKKESSLFLFRDYAKVAAAVEPNAKSDIIKPEVNLNKLFWSKPRSLALAADSPYRINDPQYKGIRRFILKLMLFYSKQSQFIRWANAIYVRVRYQVDRRAIYDVFSLEQTFKTTFSLLVLHMWLCLRRLKEEGKDGVELGQYLFEIYNHDLELRVSKAGVNLLLSKWMKELEKIFYGNIVAYDAAIGKHDDLQNVIWRNVYSDDGTSKPSKGALVSVQAFTRYVRREASSLSLTDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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