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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002235`

染色体: Chr02 坐标: 39689965-39695260 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002235`
名称	SmilChr02G002235
描述	short integuments 2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39689965 - 39695260 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012415`
GeneID	`131012415`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012415`
原始查询	`LOC131012415`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	short integuments 2, mitochondrial-like
产物	short integuments 2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G41670` (AT2G41670) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818765] identity=68.9; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0447300` (OsRALF-1) - identity=63.8; qcov=0.981; evalue=1.67e-165; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005739 (mitochondrion)
KEGG	-
Pfam	PF01926 (MMR_HSR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012415

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057796349.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057796349.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796349.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796349.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796349.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39691514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B6,B8,C22
`Chr2:39691609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B110,C22
`Chr2:39691610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B110,C22
`Chr2:39691613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B6,B8,C22
`Chr2:39691620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B6,B8,C22
`Chr2:39691643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C62,D3
`Chr2:39692291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:39692877`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D3
`Chr2:39692877`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D3
`Chr2:39692902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:39693158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr2:39693164`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796349.1

377 aa

188

377

MMR_HSR1

PF01926 MMR_HSR1 137-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796349.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	137	241	1.5e-13	51.6	50S ribosome-binding GTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940366.1
CAACTTTGATAAGTAAAATGAAGCCCAAACTAAAAACTCTCTCTTCTCTCTCTCTCATATGCAATCGGTCTCCTCTCTCTCCTCGTATCTCTCCCTCTCTCAATCTCACAGATACGCACACACATCCCCCACCGGTTCCTCCTCCGGCGAAGGCGCCGTCTTCGACCACCTACGCCACAAGCATCTCCTCCGTCTCACCTCTCGCTCCCTGTCTACCCCCTTCTATCACTCAGCGCGCACGGCGAGGCTGCATATGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012415
ATGGCGAGAAACATAGTGAAGAAAGCATCGTTAATCGGTGAAATGGGCTTCATCAAAGGCGGCGGCATGATCAACTGGTTCCCCGGCCACATGGCTAGTGCCACTCGGGCCATCCGCGACCGCCTCAAACTCTCCGATTTCGTCATCGAAGTTCGGGACGCCCGTATACCATTGTCATCTAAGAATGATGAACTGCAGCCTTTGCTGGCGGGTAAAAAGCGCGTCATTGTTCTCAATAAGAAAGATTTGGCCAACCCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796349.1
MARNIVKKASLIGEMGFIKGGGMINWFPGHMASATRAIRDRLKLSDFVIEVRDARIPLSSKNDELQPLLAGKKRVIVLNKKDLANPNIMHKWIEYFDSVKQDCLMINAHCRSSVQKLLDLVEYKMKEAIRKEPTLLVLVVGVPNVGKSVLINSIHQIASSRFPVQGKRKRATVGPLPGVTQDIAGFKIAHQPSIYVLDTPGVLVPSIPDIETGLKLAAAGSVKDSVVGEERIAQYLLAVLNSRGTPLHWRRFMDVETDRH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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