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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005310`

染色体: Chr01 坐标: 70348448-70348924 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005310`
名称	SmilChr01G005310
描述	dirigent protein 11-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70348448 - 70348924 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012438`
GeneID	`131012438`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012438`
原始查询	`LOC131012438`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dirigent protein 11-like
产物	dirigent protein 11-like
Arabidopsis	`AT1G22900` (AT1G22900) Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838897] identity=36.3; qcov=0.89; evalue=1.83e-18; confidence=low
Rice	`Os12g0174700` - identity=39.4; qcov=0.78; evalue=3.28e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03018 (Dirigent)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012438

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057796380.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796380.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796380.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796380.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796380.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70348678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C1
`Chr1:70348678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:70348685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:70348768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B63
`Chr1:70348823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B50,C50,C76
`Chr1:70348859`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B110
`Chr1:70348859`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B110
`Chr1:70348895`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B131,B50,C50,C76
`Chr1:70348895`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B131,B50,C50,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796380.1

127 aa

127

Dirigent

PF03018 Dirigent 24-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796380.1`	Pfam	`PF03018`	Dirigent	Family	24	123	4.3e-22	79.1	Dirigent-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940397.1
ATGTGTACGCGAGAAAGCAAGGCTACGTTGCGGAGGAAGCGCAACATCTTCAGTGGGAAAGAAAATGTCGCGAAGCTCCAATTATACGTCCAAGATCTTCGGGTTGGAAACCCTCACGCCACTGTGTTCGAGGTGGCGAAATCCTCGATCACCGATGCGTCTGCGTACGGCTTCGGCAGCATCCACGTTCTCGACGACCTGATCACGGAGGAGCCAGACATCAACTCCCGGCCACTCGGCCGCGTCCAAGGGCTCACCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012438
ATGTGTACGCGAGAAAGCAAGGCTACGTTGCGGAGGAAGCGCAACATCTTCAGTGGGAAAGAAAATGTCGCGAAGCTCCAATTATACGTCCAAGATCTTCGGGTTGGAAACCCTCACGCCACTGTGTTCGAGGTGGCGAAATCCTCGATCACCGATGCGTCTGCGTACGGCTTCGGCAGCATCCACGTTCTCGACGACCTGATCACGGAGGAGCCAGACATCAACTCCCGGCCACTCGGCCGCGTCCAAGGGCTCACCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796380.1
MCTRESKATLRRKRNIFSGKENVAKLQLYVQDLRVGNPHATVFEVAKSSITDASAYGFGSIHVLDDLITEEPDINSRPLGRVQGLTTNADLSTYGVHLNLNFYFTVGKLAGSTLSILGRNQILDLFF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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