当前解析结果
SmilChr02G000112| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000112 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000112 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000112 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 1426595 - 1427393 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131012534 |
|---|---|
| GeneID | 131012534 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012534 |
| 原始查询 | LOC131012534 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012534 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057796499.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057796499.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796499.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057796499.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057796499.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:1426647 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A4,B105,C54,C65 |
Chr2:1426655 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B77,C18,C63 |
Chr2:1426671 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr2:1426711 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,A24,B28,D3 |
Chr2:1426745 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B10,B110,B39,B4,C14,C17 |
Chr2:1426794 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 70 | A1,A11,A8,A9,B1,B10,B100,B108,B112,B118,B122,B125,B126,B129,B133,B140,B15,B19,B2,B27,B30,B34,B36,B42,B43,B47,B59,B6,B69,B71,B72,B82,B83,B9,B90,B92,B97,B98,C13,C17,C18,C2,C20,C25,C28,C30,C33,C35,C36,C37,C38,C4,C45,C46,C48,C5,C59,C63,C65,C69,C71,C73,C74,C76,C79,C82,C85,C87,D5,D9 |
Chr2:1426796 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B123 |
Chr2:1426817 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A4,B105,B75,C65 |
Chr2:1426826 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B5,B54 |
Chr2:1426841 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B47,C27 |
Chr2:1426864 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B121,B94,C37,C41,C71 |
Chr2:1426875 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 81 | A10,A13,A14,A18,A19,A21,A23,A24,A25,A3,A9,B103,B106,B11,B112,B113,B115,B117,B118,B120,B123,B125,B129,B13,B131,B133,B134,B136,B19,B26,B28,B36,B37,B4,B42,B47,B48,B49,B50,B54,B57,B65,B67,B75,B76,B81,B84,B85,B87,B89,B93,B95,B99,C11,C14,C16,C18,C2,C23,C31,C32,C33,C38,C39,C40,C44,C45,C51,C52,C58,C6,C61,C62,C65,C68,C74,C79,C8,C80,C81,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。