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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000123`

染色体: Chr02 坐标: 1689149-1692030 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000123`
名称	SmilChr02G000123
描述	altered inheritance of mitochondria protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1689149 - 1692030 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012540`
GeneID	`131012540`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012540`
原始查询	`LOC131012540`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	altered inheritance of mitochondria protein 3-like
产物	altered inheritance of mitochondria protein 3-like
Arabidopsis	`AT5G14540` (AT5G14540) basic salivary proline-rich-like protein (DUF1421) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831305] identity=39.9; qcov=0.53; evalue=8.39e-52; confidence=medium
Rice	`Os05g0169400` - identity=39.1; qcov=0.967; evalue=1.57e-84; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07223 (DUF1421)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012540

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057796506.1`
2	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057796506.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796506.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057796506.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057796506.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1689576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:1689598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B128,C23,C5,C61
`Chr2:1689620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr2:1689680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A5,B124
`Chr2:1691170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B45,B90,C63
`Chr2:1691176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr2:1691602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B32,B51,C42
`Chr2:1691747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796506.1

581 aa

290

581

DUF1421

PF07223 DUF1421 526-569 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796506.1`	Pfam	`PF07223`	DUF1421	Domain	526	569	1.7e-19	70.1	UBA-like domain (DUF1421)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940523.1
TAGCTCAAAATATCACTTAACCTTCCGCGACAAGTAATGCAGACGACTCCACACTCGTCATCTTCTTCCTCCCATCGTTTCATTTTTCATTTTTTTTCTGTTTAATTATTCCAAAAAACATATCCAAAATCGAGCATCTTTTCCAAAACCCTAATCCCAAAATTCCCGATTTCTGCTTCGAGCTATATTTAAGCGCCAGCAGTTTGATTCGATTTTGGTCGATTGAGGACTCAGATGAATAACAGTACGGCGTCTCAGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012540
ATGAATAACAGTACGGCGTCTCAGTACATGGACAAGCAGATCATGGATCTCTCCAATTCCCAGAGCAACATCGCCGGCAGCAATGGCGGCGGCGGCGCGGATTTCATCGATTTCATGAACCGCCCCGCGGAGAAGAAGGAGGACATGGTCCCGAGCTACGATTTCATGCCGATTCGACCCGCCACCGCCGCGGCGGCGTCGTCGTCGCCCAAGGCCGCTCGCTCGAACTTCGACTCGGACAATGACGATCCTCCCCTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796506.1
MNNSTASQYMDKQIMDLSNSQSNIAGSNGGGGADFIDFMNRPAEKKEDMVPSYDFMPIRPATAAAASSSPKAARSNFDSDNDDPPLRTWNSVDSKANSSPIRNYNSVDVDEPAKFVLGKNHKTGSAPLDGTLVSDIERMMKKHMDNLIHAIDNMSSRLSQLETRSRNLEHSIDDLKTSVGNNHGAIDGKMRLLENILTEVQSGVKVVRDKQDIVEAQLQIAKMQLPKAEHIESKINAQPDPMQTGVPTQHQFSNVPLTQA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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