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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005380`

染色体: Chr01 坐标: 71030429-71031319 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005380`
名称	SmilChr01G005380
描述	F-box/FBD/LRR-repeat protein At3g26920-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71030429 - 71031319 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012541`
GeneID	`131012541`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012541`
原始查询	`LOC131012541`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/FBD/LRR-repeat protein At3g26920-like
产物	F-box/FBD/LRR-repeat protein At3g26920-like
Arabidopsis	`AT1G80960` (AT1G80960) F-box and Leucine Rich Repeat domains containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844436] identity=29; qcov=0.828; evalue=8.19e-12; confidence=low
Rice	`Os07g0285200` (OsFbox363) - identity=29; qcov=0.804; evalue=1.4e-13; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012541

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796509.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057796509.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796509.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796509.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796509.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71030432`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A4,B10,B114,B139,B56,C15,D4
`Chr1:71030551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B22,B49,B74
`Chr1:71030577`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	30	A16,A22,A7,B100,B103,B108,B112,B12,B128,B139,B25,B26,B41,B61,B7,B70,B76,B87,C11,C17,C23,C25,C66,C69,C71,C77,C81,C85,D11,D6
`Chr1:71030628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr1:71030634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B70,C69
`Chr1:71030755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr1:71030766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C56,C65
`Chr1:71030794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A21,B111,B133,B17,B21,B40,B82,B86,C1,C48,C58,C62,C82
`Chr1:71030847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A1,A7,A9,B127,B137,B79,C78
`Chr1:71030928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B29,B62,B89,D9
`Chr1:71030951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C70
`Chr1:71030969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796509.1

296 aa

148

296

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 15-52 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 104-242 aa PF24758 LRR_At5g56370 148-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796509.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	15	52	1e-06	29.1	F-box domain
`XP_057796509.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	104	242	1.1e-07	32.4	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057796509.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	148	232	1.7e-08	35.1	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940526.1
TATGGTACTAATAAACAGTCACCCAGTGATAATGCCGACATTGATAAGTTGGCTGATGAATTACTGGTTCACATTCTGTCTCGCATGAGCCTCAAGGAAGCTGCAAGGACTTGCATCCTTGCGCGTAGATGGAGATATTTATGGAGGTCTGTGTCTGGAACCTTGCAATTTGATGTTAGGGATTTTGTGACTGCCGCTGGAGATGGAATGGAAGTGGAGAAGTTTGTGTCTTGGGTGAATACTGTGTTGGAGCTTCATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012541
TATGGTACTAATAAACAGTCACCCAGTGATAATGCCGACATTGATAAGTTGGCTGATGAATTACTGGTTCACATTCTGTCTCGCATGAGCCTCAAGGAAGCTGCAAGGACTTGCATCCTTGCGCGTAGATGGAGATATTTATGGAGGTCTGTGTCTGGAACCTTGCAATTTGATGTTAGGGATTTTGTGACTGCCGCTGGAGATGGAATGGAAGTGGAGAAGTTTGTGTCTTGGGTGAATACTGTGTTGGAGCTTCATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796509.1
YGTNKQSPSDNADIDKLADELLVHILSRMSLKEAARTCILARRWRYLWRSVSGTLQFDVRDFVTAAGDGMEVEKFVSWVNTVLELHQGRYIEGIVVIFCFGMNEKQLETIHTARIARVVDSWVYVAVKKELERFELHLPWATHHKFPSIEMLKSHSHGGSNSSPFCRLKILRLLEVPIEDEVVHYFLASCPNLEQLFIYHSDDTKNIRVVDPPSLRVLEIKSWYLESLEISAESLVSLAHVAPRICDLKKVPNLDELTIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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