当前解析结果
SmilChr01G005396| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005396 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005396 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005396 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 71233151 - 71233672 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131012566 |
|---|---|
| GeneID | 131012566 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012566 |
| 原始查询 | LOC131012566 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT2G13770 (AT2G13770)nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=51; qcov=0.601; evalue=1.14e-25; confidence=medium |
| Rice | Os01g0872900- identity=58.9; qcov=0.647; evalue=2.13e-39; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012566 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057796534.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057796534.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057796534.1 |
| 4 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057796534.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796534.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:71233161 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr1:71233175 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B36,C59 |
Chr1:71233305 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A23 |
Chr1:71233328 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A23,B56 |
Chr1:71233355 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A23,C60 |
Chr1:71233370 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C42,C51,C69 |
Chr1:71233375 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C49 |
Chr1:71233390 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B111,C71,C86 |
Chr1:71233403 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B93,C2,C21 |
Chr1:71233407 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B93,C2 |
Chr1:71233420 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 22 | A10,A23,A3,B103,B11,B133,B17,B29,B31,B40,B45,B50,B62,B71,B76,B78,B89,C1,C62,C72,C79,D9 |
Chr1:71233429 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,B13,C32 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。