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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000161`

染色体: Chr02 坐标: 2107167-2110343 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000161`
名称	SmilChr02G000161
描述	tetraspanin-19-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2107167 - 2110343 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012575`
GeneID	`131012575`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012575`
原始查询	`LOC131012575`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tetraspanin-19-like
产物	tetraspanin-19-like
Arabidopsis	`AT2G20740` (AT2G20740) Tetraspanin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816603] identity=54.7; qcov=0.995; evalue=4.75e-86; confidence=high
Rice	`Os04g0679900` - identity=54; qcov=1; evalue=2.04e-76; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00335 (Tetraspanin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012575

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057796541.1`
2	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.60000	`XP_057796540.1`
3	Endosome	内体	0.60000	`XP_057796540.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.60000	`XP_057796540.1`
5	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057796541.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2108635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C82
`Chr2:2108802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:2109970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:2110033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C28
`Chr2:2110106`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A9,B122,B20,B51,C61,C75,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796540.1

230 aa

115

230

Tetraspanin

PF00335 Tetraspanin 11-109 aa

XP_057796541.1

213 aa

106

213

Tetraspanin

PF00335 Tetraspanin 11-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796540.1`	Pfam	`PF00335`	Tetraspanin	Family	11	109	3e-13	50.7	Tetraspanin family
`XP_057796541.1`	Pfam	`PF00335`	Tetraspanin	Family	11	109	2.1e-13	51.2	Tetraspanin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940558.1
CGCAACACTATTCTTGGAAATTGGAGCATTTGGTATTGGATATTTAGACCTCTGTTTCTTCCTTCCTATCCATCTATTCTACGCTAGCTAACCCTGACTTCGATTTTCTCCAAGTTAGGGTTTCCCACTTCCGCCGCGGCTCCCGATCCCCAATTTTTCCATTCGCGGATCAATTCTTCGGGAGCTGAGGTGATTCCAACAATTTATTTGACGATTTTAAAAAACAAAAACAAAAAATGGGTCGAATGGCGCGCAGCTGC...

XM_057940557.1
TCTTGGAAATTGGAGCATTTGGTATTGGATATTTAGACCTCTGTTTCTTCCTTCCTATCCATCTATTCTACGCTAGCTAACCCTGACTTCGATTTTCTCCAAGTTAGGGTTTCCCACTTCCGCCGCGGCTCCCGATCCCCAATTTTTCCATTCGCGGATCAATTCTTCGGGAGCTGAGGTGATTCCAACAATTTATTTGACGATTTTAAAAAACAAAAACAAAAAATGGGTCGAATGGCGCGCAGCTGCGTTCAATCTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012575
ATGGGTCGAATGGCGCGCAGCTGCGTTCAATCTCTGCTCAAGCTGGTCAATTCGCTCCTCGGAATGGTTGGAATCGCCATGATCATCTACTCGCTCTGGATGTTTAGAGTCTGGCTCCGCACCGACGAATCCATTAACGTTCCCGTTCCGTGGTTTATATACACTATTCTGGGCCTTGGTGCTAGTTTGTGCGTGATCACGTGCTCTGGTCACATTGCTGCGGAGACTGCCAATGGTTGTTGCTTGTACATTTACATGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796540.1
MGRMARSCVQSLLKLVNSLLGMVGIAMIIYSLWMFRVWLRTDESINVPVPWFIYTILGLGASLCVITCSGHIAAETANGCCLYIYMAFVFMIFVLEAAVTADVFLNHDWQEDFPSDATGNLDRLKDFVKDNFDICKWVGLSVVVVQGLSMFLATVLKALGPHSEKYYESDDEYLPDRVPLLKNYVPPQSYGSEPTYGVKSDSWSVRTNSKVRAFIILKVSSHLHDRNVNL

XP_057796541.1
MGRMARSCVQSLLKLVNSLLGMVGIAMIIYSLWMFRVWLRTDESINVPVPWFIYTILGLGASLCVITCSGHIAAETANGCCLYIYMAFVFMIFVLEAAVTADVFLNHDWQEDFPSDATGNLDRLKDFVKDNFDICKWVGLSVVVVQGLSMFLATVLKALGPHSEKYYESDDEYLPDRVPLLKNYVPPQSYGSEPTYGVKSDSWSVRTNSKTLR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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