当前解析结果
SmilChr02G000169| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000169 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000169 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000169 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 2177866 - 2178795 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131012583 |
|---|---|
| GeneID | 131012583 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012583 |
| 原始查询 | LOC131012583 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | pyrroline-5-carboxylate reductase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825660]; symbol=AT4G03600; hit=AT4G03600; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | pyrroline-5-carboxylate reductase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825660]; symbol=AT4G03600; hit=AT4G03600; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT4G03600 (AT4G03600)pyrroline-5-carboxylate reductase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825660] identity=56.7; qcov=0.857; evalue=1.27e-54; confidence=high |
| Rice | Os12g0295600- identity=55.5; qcov=0.731; evalue=7.51e-32; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012583 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057796549.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057796549.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057796549.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057796549.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796549.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:2178158 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C57 |
Chr2:2178377 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B124,B37,C48 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。