当前解析结果
SmilChr02G000185| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000185 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000185 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000185 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 2336804 - 2337958 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131012601 |
|---|---|
| GeneID | 131012601 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012601 |
| 原始查询 | LOC131012601 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012601 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057796568.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057796568.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796568.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057796568.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057796568.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:2337051 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 16 | A10,B107,B132,B45,B5,B54,B77,B88,C14,C36,C53,C72,C9,D10,D11,D8 |
Chr2:2337065 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,C81 |
Chr2:2337084 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | A10,B132,B5,C53,D10 |
Chr2:2337084 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | A10,B132,B5,C53,D10 |
Chr2:2337097 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B103,C75,C81,C9 |
Chr2:2337126 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 21 | A14,B100,B106,B138,B17,B61,B75,B81,B83,B93,C30,C32,C35,C41,C43,C51,C54,C68,C71,D3,D4 |
Chr2:2337132 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr2:2337136 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B55,B57,B72,C13 |
Chr2:2337146 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 9 | A7,B18,B86,C1,C26,C47,C75,C82,C86 |
Chr2:2337151 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B55,B57,B72,C13 |
Chr2:2337177 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A18,B122,B6,B88,C22,C67 |
Chr2:2337184 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B88,C14,C72 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。