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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000271`

染色体: Chr02 坐标: 3494559-3497547 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000271`
名称	SmilChr02G000271
描述	uncharacterized SmilChr02G000271
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	3494559 - 3497547 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012672`
GeneID	`131012672`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012672`
原始查询	`LOC131012672`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TraB family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837027]; symbol=AT1G05270; hit=AT1G05270; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TraB family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837027]; symbol=AT1G05270; hit=AT1G05270; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G05270` (AT1G05270) TraB family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837027] identity=42.9; qcov=0.993; evalue=7.98e-65; confidence=medium
Rice	`Os05g0499500` - identity=38.6; qcov=1.02; evalue=9.81e-58; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01963 (TraB_PrgY_gumN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012672

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057796642.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057796642.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.60000	`XP_057796642.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796642.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796642.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:3494748`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B102,B106,B112,B15,B20,B36,B37,B8,B94,C22,C41,C71,D11
`Chr2:3494768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:3494779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B111
`Chr2:3494929`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B72
`Chr2:3494929`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B72
`Chr2:3494930`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A3,B100,B46,B83,C22,C60
`Chr2:3494933`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B100,B46,B83,C22,C60
`Chr2:3494933`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B100,B46,B83,C22,C60
`Chr2:3494950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:3494977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr2:3494985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C1
`Chr2:3495200`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	56	A18,A24,B102,B103,B106,B107,B110,B112,B121,B124,B127,B132,B139,B15,B16,B19,B20,B22,B25,B34,B37,B4,B5,B54,B6,B60,B71,B75,B79,B8,B86,B88,B94,C10,C11,C13,C22,C25,C27,C41,C43,C52,C6,C62,C63,C67,C69,C70,C71,C8,C83,C87,D2,D3,D5,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796642.1

284 aa

142

284

TraB_PrgY_gumN

PF01963 TraB_PrgY_gumN 172-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796642.1`	Pfam	`PF01963`	TraB_PrgY_gumN	Family	172	243	8.4e-16	59.3	TraB/PrgY/gumN family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940659.1
AAGTTTACACAACAATTCAAGAAAAACGATCTTGAATAAGTCTATACATTTTTCTATATAAATAGTGAATCAGTGAACAACTTGTTCAATAATCGCATTCACTCCAAGATGTACGGATTAAACCCTCTCAATTCGGCCGCTCTCTTCGCCGCTGCCGCCGCCGTCTCGAAACGGTGCCTCAGATCTATTCCGATCTATCGCTCTCTTTCAGCGACAGCCGGATTCGGTAAGAGGAAAAGGCTGCCGGTGGAGCTCTCGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012672
ATGTACGGATTAAACCCTCTCAATTCGGCCGCTCTCTTCGCCGCTGCCGCCGCCGTCTCGAAACGGTGCCTCAGATCTATTCCGATCTATCGCTCTCTTTCAGCGACAGCCGGATTCGGTAAGAGGAAAAGGCTGCCGGTGGAGCTCTCGGGGAGTGTCACGATGCTCACGTGCGAGTCAGCCGCGCGCGGCGGCGTTTGCACTGTGTATTTGATCGGAACCTCTCATCGTTCTCCGAAATCTTGTCAGGAAGTTAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796642.1
MYGLNPLNSAALFAAAAAVSKRCLRSIPIYRSLSATAGFGKRKRLPVELSGSVTMLTCESAARGGVCTVYLIGTSHRSPKSCQEVKQLIRLIKPEAVLVELCPSRAKYLKPKTGESNTRGEFQVAYEEANKYGAKFVLGDRPKEITLRRLRVMASLWDVCLYLRKNTTNKVIDTIKLFKRVDDAKICAASQELAKISPTFFKTFVHERDQYITVKLLEVAREHSSVVAVVGKAHLPGIRENWKQPVDMKQLLHVPIVKRI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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