当前解析结果
SmilChr02G000275| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000275 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000275 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000275 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 3519795 - 3523906 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131012675 |
|---|---|
| GeneID | 131012675 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012675 |
| 原始查询 | LOC131012675 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os08g0447300; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os08g0447300; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT4G25770 (AT4G25770)alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828682] identity=50; qcov=0.927; evalue=2.16e-27; confidence=medium |
| Rice | Os08g0447300- identity=57.8; qcov=0.732; evalue=1.04e-28; confidence=medium |
| GO | GO:0044255 (GO:0044255) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012675 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057796649.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057796651.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057796649.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057796651.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796651.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:3520019 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B47 |
Chr2:3520499 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:3521478 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B42,C32 |
Chr2:3521478 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B42,C32 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。