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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000372`

染色体: Chr02 坐标: 4713118-4719768 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000372`
名称	SmilChr02G000372
描述	GBF-interacting protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4713118 - 4719768 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012713`
GeneID	`131012713`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012713`
原始查询	`LOC131012713`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GBF-interacting protein 1-like
产物	GBF-interacting protein 1-like
Arabidopsis	`AT3G07660` (AT3G07660) flocculation protein (DUF1296) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819957] identity=36.2; qcov=1.03; evalue=2.05e-111; confidence=medium
Rice	`Os06g0206100` - identity=44.1; qcov=0.139; evalue=1.07e-16; confidence=weak
GO	GO:0051082 (GO:0051082)
KEGG	-
Pfam	PF06972 (GIP1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012713

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057796686.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057796686.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057796686.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057796686.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057796686.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4713486`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B21,B36,B37,B69,B72,C1
`Chr2:4713617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B59
`Chr2:4713626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C1
`Chr2:4714272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B37
`Chr2:4715310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B36,B88
`Chr2:4715321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C1
`Chr2:4716189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr2:4716220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B36
`Chr2:4716282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr2:4716287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B59,C39,C43
`Chr2:4716383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B78,B89,C49,C60,C83
`Chr2:4716429`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B21,B25,B36,B69,B72,C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796686.1

849 aa

424

849

GIP1_N

PF06972 GIP1_N 18-78 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796686.1`	Pfam	`PF06972`	GIP1_N	Domain	18	78	7e-30	103.7	GBF-interacting protein 1 N-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940703.1
AGGTCTAGTCTACCCACCCCAACTGAGAGAGTGTGCAGTAGAGGTACAAAAAAGGCTGCTACACAAAGCATGAAAAAACATTTGAACTTTTAGCAAATCAACATCTCATTATGCCCCAAATCAGCCCCATTTATGCGCACGCTTCGTAAGATCACCAAAAACCCTTTTTCCGCTCGCGACGTCTCCTTTCTCACCAAAGCTGCAGCGGAGGTAGGTGTTGGGGGCGGGGGATTGCGGTAGACGATGAGCAGTTGGGGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012713
ATGAGCAGTTGGGGCAAGGGAGGGGCAGCAGCGCCGCGTACTAGAGTTGCGATTCCGAGCAGCGTGAAGAAGACGATCGATGATATTAAGGAGATCACGGGGCAGAATCATGGAGACGATGAGATTTATGCAATGCTCAAGGAATGTTCCATGGATCCGAATGAGACCGCTCAGAAGCTTCTTCTTCTCGATGCTTTCCATGAAGTGAAAAAGAGACGTGACAGGAGAAGAGAGAATCCGAATAAGGAGCCTGCACAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796686.1
MSSWGKGGAAAPRTRVAIPSSVKKTIDDIKEITGQNHGDDEIYAMLKECSMDPNETAQKLLLLDAFHEVKKRRDRRRENPNKEPAQLRRRQGSQAQVNRASHENYSYRPLSHDAGGGRNSFAVKENLTSQFPEKVVGNATLGNTQKIKSNEASSVSSPVTGISDCPSGITSQSTNSNKNGSVWASGNVNKFNGSTNSSMSKLEESLPLSSPVYSNKNVGSPGPRDIRQNEMLDSSNRAVSLPRVSASGSQSSPLDPLLSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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