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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000385`

染色体: Chr02 坐标: 4799807-4804233 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000385`
名称	SmilChr02G000385
描述	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4799807 - 4804233 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012728`
GeneID	`131012728`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012728`
原始查询	`LOC131012728`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
产物	2%2C3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
Arabidopsis	`AT1G09780` (iPGAM1) Phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837507] identity=83.8; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0482700` - identity=86.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006007 (glucose catabolic process); GO:0030145 (manganese ion binding); GO:0046537 (GO:0046537)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00260 (Glycine, serine and threonine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01676 (Metalloenzyme); PF06415 (iPGM_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012728

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057796707.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057796707.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057796707.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796707.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796707.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4800165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:4802365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr2:4802488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr2:4802665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B104
`Chr2:4803315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:4803638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B26,B88
`Chr2:4803927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,D11
`Chr2:4803945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,D7
`Chr2:4803948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C74
`Chr2:4803971`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A19
`Chr2:4803971`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A19
`Chr2:4803973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796707.1

557 aa

278

557

Metalloenzyme

iPGM_N

PF01676 Metalloenzyme 22-544 aa PF06415 iPGM_N 101-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796707.1`	Pfam	`PF01676`	Metalloenzyme	Family	22	544	1.8e-88	297.0	Metalloenzyme superfamily
`XP_057796707.1`	Pfam	`PF06415`	iPGM_N	Domain	101	322	5.4e-58	196.7	BPG-independent PGAM N-terminus (iPGM_N)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940724.1
TATCAAAAAGCAGGGGACTGTCACATGACACCCCACCCCCACCCACCTACCCCAACCCCCCACCCCACGTTTGAGTATTTAAATACAACTTCCGATCATAAAAAGCTCCTAACTTTGCTCTCTCAAACCTAATTTTTTCAGATTATATTGTCCATTAACAGCAAATTCGAGATGGGTAGCTCTGGATTCTCATGGAAATTGAACGATCACCCCAAACTGCCCAAGGGGAAGATCGTAGCAATGGTGGTTTTGGATGGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012728
ATGGGTAGCTCTGGATTCTCATGGAAATTGAACGATCACCCCAAACTGCCCAAGGGGAAGATCGTAGCAATGGTGGTTTTGGATGGATGGGGTGAGGCCAATCCCAATCAGTACAACTGCATCCATATTGCCGAAACTCCCACCATGGATTCACTTAAAAAGGGTGCTCCTGAAAAGTGGAGATTGGTTAAGGCCCACGGTAAAGCTGTGGGGCTGCCCACAGATGATGACATGGGCAACAGTGAGGTTGGCCACAATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796707.1
MGSSGFSWKLNDHPKLPKGKIVAMVVLDGWGEANPNQYNCIHIAETPTMDSLKKGAPEKWRLVKAHGKAVGLPTDDDMGNSEVGHNALGAGRIFAQGAKLVDSALETGKIYDGEGFNYIKESFATGTLHLIGLLSDGGVHSRIDQLQLLLKGASERGAKRIRVHILTDGRDCLDGSSVGFVETLENDLVKLREKGIDAQVASGGGRMYVTMDRYENDWEVVKRGWDAQVLGEAPHKFKSAVEAVKKLREIPNTSDQYLPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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