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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000357`

染色体: Chr02 坐标: 4601080-4603103 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000357`
名称	SmilChr02G000357
描述	BTB/POZ domain-containing protein At5g48130
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4601080 - 4603103 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012734`
GeneID	`131012734`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012734`
原始查询	`LOC131012734`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein At5g48130
产物	BTB/POZ domain-containing protein At5g48130
Arabidopsis	`AT5G48130` (AT5G48130) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834865] identity=38.4; qcov=1.26; evalue=5.04e-110; confidence=medium
Rice	`Os07g0584200` - identity=40.5; qcov=0.988; evalue=4.63e-84; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012734

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057796713.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057796713.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057796714.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796713.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796713.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4601264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B65,C48
`Chr2:4601367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr2:4601383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B4,C23,C3,C30
`Chr2:4601487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:4601548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:4601628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C3,C30
`Chr2:4601837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:4601882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B34,B64,C82
`Chr2:4601920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B58
`Chr2:4601926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C48
`Chr2:4601956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:4602046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796713.1

495 aa

248

495

NPH3

PF03000 NPH3 194-390 aa

XP_057796714.1

422 aa

211

422

NPH3

PF03000 NPH3 121-317 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796713.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	194	390	1.2e-39	137.2	NPH3 family
`XP_057796714.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	121	317	6.4e-40	138.2	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940730.1
GTTCAAACCTCTATCCCCATGCAAGATGATGATTAAATAAAACAAGGAAGATATAGCTAGATATCACTTACATTCTCTGACATTTGTATATGTTAATTAGTGAGAGACATGAACGTTGCTGCCTTGCTCAAGATCAAGGTTCTTTCATGGAGCCAAGAAACTGGGTTTCCTGTGGGCATTCGTGTTCGGATTGCCGACAGAAGCTTCAACCTGCACAAGGTCCCACTGAGACGCAAGAGCAGGTATTTGAGGGAGAAGCT...

XM_057940731.1
ATAGCTAGATATCACTTACATTCTCTGACATTTGTATATGTTAATTAGTGAGAGACATGAACGTTGCTGCCTTGCTCAAGATCAAGGAGCCAAGAAACTGGGTTTCCTGTGGGCATTCGTGTTCGGATTGCCGACAGAAGCTTCAACCTGCACAAGGTCCCACTGAGACGCAAGAGCAGGTATTTGAGGGAGAAGCTGAAAGACGAGGAGACAAAGGAAGTGGAGCTGCCTCCGGATTTCCCGGGCGGAGCGGAGGCCTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012734
ATGAACGTTGCTGCCTTGCTCAAGATCAAGGTTCTTTCATGGAGCCAAGAAACTGGGTTTCCTGTGGGCATTCGTGTTCGGATTGCCGACAGAAGCTTCAACCTGCACAAGGTCCCACTGAGACGCAAGAGCAGGTATTTGAGGGAGAAGCTGAAAGACGAGGAGACAAAGGAAGTGGAGCTGCCTCCGGATTTCCCGGGCGGAGCGGAGGCCTTCGAGATGGCGGCGCTCTTGATGTACGGCTACGGCGCATTAGTAGA...

LOC131012734
ATGGCGGCGCTCTTGATGTACGGCTACGGCGCATTAGTAGAAACGGCCAACGTGGCGGCTCTGAGATGCGCGGCGGAGTTTTTGGAGATGCCGATCCACTGCCAAGGGCTGGACATGTATCTCAATCAGGTGGTCCTGCAGAGCTGGAAGGAGACTGTGACGGTGCTGCAGAGCTGCCGAGGGACGTTGCTCCCCTGGGCAGAAGACGTGCTCCTCGTCACCCGCTGCATCGAGACTCTCGCCTTCATGGCGTGCATGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796713.1
MNVAALLKIKVLSWSQETGFPVGIRVRIADRSFNLHKVPLRRKSRYLREKLKDEETKEVELPPDFPGGAEAFEMAALLMYGYGALVETANVAALRCAAEFLEMPIHCQGLDMYLNQVVLQSWKETVTVLQSCRGTLLPWAEDVLLVTRCIETLAFMACMEILDPERRPGQALQLQLQACWPWSDAVVGDVMSRDVWMRDVVALPVAFFKRVIASLRRQGMKEKYVSTIILLYAHRYSSSSSALADLLPERGSRVIPVGFY...

XP_057796714.1
MAALLMYGYGALVETANVAALRCAAEFLEMPIHCQGLDMYLNQVVLQSWKETVTVLQSCRGTLLPWAEDVLLVTRCIETLAFMACMEILDPERRPGQALQLQLQACWPWSDAVVGDVMSRDVWMRDVVALPVAFFKRVIASLRRQGMKEKYVSTIILLYAHRYSSSSSALADLLPERGSRVIPVGFYLSLLAASGGLRNESVEKKIASMLHLAQPRDLAGIELSVVERIFMDSDTSSPAVAQLWDCYLTQIAADPHLPCT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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