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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000379`

染色体: Chr02 坐标: 4766030-4769715 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000379`
名称	SmilChr02G000379
描述	uncharacterized SmilChr02G000379
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4766030 - 4769715 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012735`
GeneID	`131012735`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012735`
原始查询	`LOC131012735`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calcium ion-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814966]; symbol=AT2G04280; hit=AT2G04280; species=arabidopsis; confidence=high
产物	calcium ion-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814966]; symbol=AT2G04280; hit=AT2G04280; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G04280` (AT2G04280) calcium ion-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814966] identity=49.2; qcov=1.13; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0456400` - identity=50.1; qcov=0.964; evalue=2.15e-153; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus)
KEGG	-
Pfam	PF23269 (DUF7074); PF23272 (DUF7075)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012735

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057796716.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796716.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796716.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796716.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796716.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4767716`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A7,A9,B127,B49
`Chr2:4767716`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A7,A9,B127,B49
`Chr2:4767784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:4767815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:4767932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C45,C49,C73
`Chr2:4767973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:4767992`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	79	A15,A16,A19,A22,A24,A4,A5,A6,A7,B1,B10,B100,B11,B111,B112,B113,B115,B117,B119,B121,B123,B126,B132,B133,B134,B136,B139,B14,B17,B19,B3,B32,B34,B35,B38,B39,B45,B46,B47,B48,B54,B58,B61,B65,B66,B68,B73,B74,B77,B78,B85,B89,B91,B93,B94,B97,C1,C10,C18,C3,C32,C35,C38,C4,C40,C41,C42,C44,C51,C54,C57,C60,C68,C77,C79,C83,C85,C86,D6
`Chr2:4768069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B139
`Chr2:4768091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B127,B139
`Chr2:4768123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:4768129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:4768257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796716.1

495 aa

248

495

DUF7074

DUF7075

PF23269 DUF7074 76-158 aa PF23272 DUF7075 189-480 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796716.1`	Pfam	`PF23269`	DUF7074	Domain	76	158	2.9e-25	89.0	Domain of unknown function (DUF7074)
`XP_057796716.1`	Pfam	`PF23272`	DUF7075	Domain	189	480	3.8e-68	230.5	Domain of unknown function (DUF7075)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940733.1
GCATGATGTATTTTCTTCTGTTCGAATCGAAATTTAAAACTAAACTTGTTTTCAGAAGGATAGATGAAGTGATTCGGGTGAGATCCAACTTTCGATACACTTGTGGGATCTAGGTCATCACGTGAGTGTAGTTATTAACATTAATGCAAGTTTAATTCAAGCATGTGAACACAAATTAAATTTGAAAGGTATGAGAGGTTTGTCAAAGTTTAAATTCCTTTATAGGGGAACTATTTTTAGGATTGTATTATCAAAGTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012735
ATGTTGCGATCGCGCCGTCATTGGTTTAGGAGCGGGAGTTTGCGCCCTGAAAATCTCGGCCACTGTTTGGGTTTCTTCGTAACCGCGGTGTTAATTTACACCATAATCGCCGCCACCTACGATGCCGGCGACGCCTTTCTCCAACCTGTCTCAGAGATCACGGCTCTACTCTCGCCGGAGTCTAATTCGACCGATCGGAAGGTTGCCAAGGCAGGTTGCGGCGTGGATGAGCCGATCAATTGCGGCGATCTGGAGGTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796716.1
MLRSRRHWFRSGSLRPENLGHCLGFFVTAVLIYTIIAATYDAGDAFLQPVSEITALLSPESNSTDRKVAKAGCGVDEPINCGDLEVFQLLMSAAFDELKDVDFYRFGKPVDGDNGSDCHMMGWFKRKEGGIDKDYRSFRVSRSENCALSVVGIGDYHSGGNAEGKAEVVEKAVDVGEIVNGDELFEEPFSRGKYLIYAGGGERCKDMGLYLWGFTCMLGEAEFLNRTLVLDTSICLSKVHTSSGVDEEGRDFRSYFDFEQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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