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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000384`

染色体: Chr02 坐标: 4793961-4795480 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000384`
名称	SmilChr02G000384
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	4793961 - 4795480 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012747`
GeneID	`131012747`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012747`
原始查询	`LOC131012747`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 2
产物	fasciclin-like arabinogalactan protein 2
Arabidopsis	`AT4G12730` (FLA2) FASCICLIN-like arabinogalactan 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826885] identity=53.5; qcov=1.03; evalue=2.32e-141; confidence=high
Rice	`Os09g0248100` (OsFLA11) - identity=50.9; qcov=0.862; evalue=7.24e-100; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02469 (Fasciclin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012747

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057796732.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057796732.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057796732.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796732.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796732.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:4794187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr2:4794209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:4794566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,C32,C68
`Chr2:4794567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C39,C6
`Chr2:4794623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:4794890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr2:4795075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B70,C1,C32,C51,C68
`Chr2:4795175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B26
`Chr2:4795223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C74
`Chr2:4795259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796732.1

383 aa

192

383

Fasciclin

PF02469 Fasciclin 29-105 aa PF02469 Fasciclin 193-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796732.1`	Pfam	`PF02469`	Fasciclin	Domain	29	105	1.1e-22	81.3	Fasciclin domain
`XP_057796732.1`	Pfam	`PF02469`	Fasciclin	Domain	193	322	1.1e-22	81.3	Fasciclin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940749.1
CAAATCATTGAGCCATGAAGAAGACATATTATAGCCAATATCATAAAAATTGTGCGTTTCATATAGTATAATATCATCTACAACATGTAAAAAATTATTTAAATATCTCATATATGTAATTCACAATGAATGTGATATATATATACACATGCATTCCCACAAAAAAAGATAGTATCTCCATTAACGGCCACCATGAAGCTCGAATTCATGATCCTCCTCCTCCTCGCCGCCACCGGCGACGCCCACAACGTCACCCGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012747
ATGAAGCTCGAATTCATGATCCTCCTCCTCCTCGCCGCCACCGGCGACGCCCACAACGTCACCCGCATCCTCGCCTCGCACCCCTCCCTCTCCACATTCAACCAATACCTCACCACCACACACCTCGCCGACGAGATCAACCGCCGCGACACCATCACCGTCTGCGCCGTGGACAACGCCGCCATGGCCGCCCTCCTCTCCCACCACTTCCCCCTCCCCACCCTCACCAACATCCTCTCCCTCCACATCTTCGCCGACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796732.1
MKLEFMILLLLAATGDAHNVTRILASHPSLSTFNQYLTTTHLADEINRRDTITVCAVDNAAMAALLSHHFPLPTLTNILSLHIFADYFGSNKLHQITKGSTTTSSLFQATGEAAGTSGYVNITDLKGGKVGFTPVDADAADQPMATFVKSIYELPYNISVIQISSILTSPEAEAPAAAPSDFNLISLLARQGCKSFSDLLTAQRSAADAFAASVDSGLTVFCPSDGAVKSFAPSYKNLTAAGKASLLLYHGAPEYNSLGM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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