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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005671`

染色体: Chr01 坐标: 72990221-72990890 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005671`
名称	SmilChr01G005671
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72990221 - 72990890 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012821`
GeneID	`131012821`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012821`
原始查询	`LOC131012821`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
产物	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
Arabidopsis	`AT5G16360` (AT5G16360) NC domain-containing protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831497] identity=44.2; qcov=0.938; evalue=1.08e-45; confidence=medium
Rice	`Os05g0440100` - identity=41.9; qcov=1.12; evalue=5.18e-45; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04970 (LRAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012821

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057796799.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057796799.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057796799.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796799.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796799.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72990465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B66,D5
`Chr1:72990527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,D3
`Chr1:72990594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:72990621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A15
`Chr1:72990627`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B106,B112,B135,B28,B50,B66,B79,C36,D3
`Chr1:72990635`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B106,B135,B28,B79,C36,D3
`Chr1:72990658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:72990671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B136,C10,C5,C85
`Chr1:72990718`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	B42,B72,B8,B95,C31,C4,C41,C44,C49,C55,C57,C68,C72,C8,C82
`Chr1:72990726`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B1,C32,C53
`Chr1:72990726`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B1,C32,C53
`Chr1:72990803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796799.1

176 aa

176

LRAT

PF04970 LRAT 14-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796799.1`	Pfam	`PF04970`	LRAT	Domain	14	146	2.7e-27	96.1	Lecithin retinol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940816.1
GTATAGAGAGAGAGAGCAGGCGATCACATCGAGTGTGAGCTAGAGATGGGGTTTGTATCACATCGAGTGGAGAGACGGTTCTTGAGAGCAGGCGATCACATTTACAGTTGGAGAACAGGCTTTGTTTACTCGCACCATGGTATCTACATGGGTGAAGACCAAGTGGTACACTTCACCTGCGCATCAGCATCAAGAAGCTGCGCAGCTTGTGAGATGTTCGAGTATAGCGATCGGGACAGCGGAGTGATCGCATCTTGTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012821
ATGGGGTTTGTATCACATCGAGTGGAGAGACGGTTCTTGAGAGCAGGCGATCACATTTACAGTTGGAGAACAGGCTTTGTTTACTCGCACCATGGTATCTACATGGGTGAAGACCAAGTGGTACACTTCACCTGCGCATCAGCATCAAGAAGCTGCGCAGCTTGTGAGATGTTCGAGTATAGCGATCGGGACAGCGGAGTGATCGCATCTTGTCTCGATTGCTTCCTTAAATCGGGATCGCTGCGCCGTTACAAGTACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796799.1
MGFVSHRVERRFLRAGDHIYSWRTGFVYSHHGIYMGEDQVVHFTCASASRSCAACEMFEYSDRDSGVIASCLDCFLKSGSLRRYKYGVSKRRYWMKRPGTCNTAESGPVEVVMERAESLLAKNGFGEYNLLKNNCEDFATFCKTGQGCNRNGTARRYGQASLIPPALASSRRNPKP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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