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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000465`

染色体: Chr02 坐标: 6225120-6227891 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000465`
名称	SmilChr02G000465
描述	uncharacterized SmilChr02G000465
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	6225120 - 6227891 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012838`
GeneID	`131012838`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012838`
原始查询	`LOC131012838`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Serine/Threonine-kinase pakA-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820740]; symbol=HCF243; hit=AT3G15095; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Serine/Threonine-kinase pakA-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820740]; symbol=HCF243; hit=AT3G15095; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G15095` (HCF243) Serine/Threonine-kinase pakA-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820740] identity=47; qcov=0.478; evalue=7.69e-64; confidence=medium
Rice	`Os06g0352900` - identity=37.1; qcov=0.511; evalue=1.31e-35; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30939 (At1g76070)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012838

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796808.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057796808.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796808.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796808.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796808.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:6225610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr2:6225691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr2:6225841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B93
`Chr2:6225859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:6225877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B93
`Chr2:6225931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr2:6226131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C42,D8
`Chr2:6226155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr2:6226169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B14,B26,B64,C37
`Chr2:6226296`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	91	A11,A13,A22,A24,A25,A3,A5,A7,B1,B101,B102,B104,B106,B107,B108,B112,B119,B121,B122,B124,B125,B128,B13,B130,B131,B135,B136,B139,B14,B2,B20,B23,B24,B26,B32,B33,B4,B41,B42,B43,B47,B48,B51,B52,B56,B58,B59,B61,B62,B64,B65,B68,B7,B77,B82,B86,B89,B90,B91,B92,B96,C11,C16,C19,C20,C25,C26,C32,C36,C37,C38,C4,C40,C44,C51,C55,C58,C59,C61,C65,C68,C69,C71,C72,C73,C75,C80,D3,D4,D6,D7
`Chr2:6226360`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B109
`Chr2:6226360`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B109

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796808.1

734 aa

367

734

At1g76070

PF30939 At1g76070 88-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796808.1`	Pfam	`PF30939`	At1g76070	Family	88	130	1.4e-06	29.2	Syringolide-induced protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940825.1
GTAGTATCATAAAATAAAGTGATATCGCCATCTCTCTTTGACACAAACACACAGACACTGTGAGTACTCCTCTCGAATTCACTCGTTATCCAGCATCCCCACAATACAAAACACAGCTTTATCACCCATTCTCCATTTCCCACTCTCATTCGTCTTGTACAATCATCACTCTCTCTCTCTCCATACCCCACCATTCTTAACTTTTACTGCACAGCAACATTCGTCCATGGCAGAAAAATTAGGGCAGTAGAAACACAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012838
ATGGACATAGATAGACCCCATTTCCGCACCACTAGCACGGGTAGCAGCAGCAGCACCGCTGCCGCCACTTCCAGCGAGCTCTTCATCTGCTTCACCTCCCGCCTCTCTTCCTCTTCCATGAAACTCTCCAAATCAATACTCAGTCCCGGCCGCGCCGCCCGCGACGCCGGCCCCGCCTCACTCTCTTCCTCCCTCAGCCGCCGCCTCCGCACCAACGGCAGCCTCAAGGGCGGCCAAGCCTCCCCCTTCTTCACCACCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796808.1
MDIDRPHFRTTSTGSSSSTAAATSSELFICFTSRLSSSSMKLSKSILSPGRAARDAGPASLSSSLSRRLRTNGSLKGGQASPFFTTTAKKRGCGFDNPEPSSPKVTCIGQVRVKTKKKVKQSRSLSKRRSGEVSFRKMEQSCGDADDKRYSNASAHYQAPQECLPQHRNQRWVHLPISICEALRTFGAEFSCLFPCRSSCFSTSEREKSEKSENGCGAVFARWLVSVNDGEGGKRREIELVVGGGDEEDEEEEQNRVSMR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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